国家微生物科学中心特别邀请了十位国内微生物组技术和大数据领域的名师,推出了一系列优秀的网络课程。本期特邀中国科学院微生物研究所胡松年研究员分享《微生物学:从课题设计到数据分析》。本课程从微生物学项目设计、数据分析过程等角度进行讲解。,包括分析常见的微生物测序技术及其优缺点,如何选择适合自己项目的测序技术,以及微生物组文章的四个基本要素。欢迎访问国家微生物数据中心网站观看学习。
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微生物遍布于已知的环境中,对环境和人类健康起着非常重要的作用。微生物是重要的分解者。对它们参与营养物质的循环,了解微生物的种群构成具有重要意义。微生物的三种主要研究方法包括16S测序、宏基因组和宏转录组。从价格、测序范围、菌群分辨率、分析难度、分析内容等方面比较每种方法的优缺点,从而选择适合本课题的测序技术。微生物组文章的四个基本要素包括样本、物种、表型数据描述、菌群物种组成的总体差异和类群的具体差异、菌群功能组成的总体差异和类群的具体差异、表型数据与微生物组的关系。
16S测序

基因组/宏转录组方法
16S测序、宏基因组和宏转录组的优缺点比较
如何选择适合自己学科的测序技术?

微生物学文章的四个基本要素
1.样本、物种和表型数据的描述
2.植物区系种类组成的总体差异和类群的具体差异。
3.菌群功能组成的总体差异和类群的具体差异。
4.表型数据与微生物组的关系


