近年来，皖南医学院适应智慧校园发展趋势，深度挖掘实验室智能化管理方法，不断加大对基础医学实验教学平台的建设力度，实验室教学科研条件得到明显改善，3个基础医学实验教学平台，承担着全校各个层次21门课程的教学任务，每年完成各项课程约4万学时，平台承载能力显著增强，育人成效进一步提升。
形态学实验实训中心实现5G无线互动
医学形态学实验实训中心目前有10个数码互动实验室，为适应5G通讯时代的到来以及智慧校园发展的需要，2020年学校新建3个进口数码显微5G无线互动实验室，2021年拟更新3个5G无线数码互动实验室。
5G无线互动实验室有网速快、观察清楚、便于师生互动、节省空间和方便操作等优点，克服了以往数码互动实验室只能进行切片显微观察、无法进行其它实验操作的缺点，提升了课堂实验教学效果。
医学机能学实验实训中心实现信息化集成化
医学机能学实验实训中心共有12个实验室，每年承担约7000实验学时，现已建成6个信息化集成化机能实验室，可同时接纳5个行政班进行实验。
新的一体化数字采集系统的应用，实现了多门课程的实验内容交叉融合，为开设综合性、创新性实验奠定了基础。
新建的人体机能学实验室含20个实验模块，配备VSP-100虚拟标准病人软件，含有15种疾病完整病例资源，通过简单、直观、生动的展示人体生理调节机制，帮助医学生更好地学习各种综合性医学知识。
人体解剖学实验实训中心实现软硬件双提升
人体解剖学是临床医学最重要的基础课之一，在提升实验室硬件的同时，学校充分运用现代多媒体和互联网技术，建成2个虚拟解剖学实验室。借助虚拟现实技术，学生可进行模拟实体解剖操作，在虚拟互动学习和操作中达到理论联系实际、学以致用的目的。虚拟解剖互动实验室的虚拟标本具有可反复操作的特点，大大减少了大体标本的用量，节约了教学成本。
基础医学虚拟仿真实验中心自主开放
皖南医学院还建有1个基础医学虚拟网络实验教学控制平台网站和1个基础医学虚拟仿真开放实验室。学生通过预约，可自行学习专业课方面的数字信息化资源，为学生提供了一个线上线下相结合的“自主学习”实验教学平台，同时还可以为学生复习、学习研讨、实验考试等提供便利。
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