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水产养殖的大棚拆迁补偿标准全国各地不同，标准是由各地省市制定的一个最低的综合区片价。具体的土地补偿及安置补偿标准，可以参看各省省国土资源厅网站。关于地上房屋设施一般按照重置价格补偿，因为属于经营，那么还应当有停产停业损失，搬迁费等补偿。
法律依据：
《国有土地上房屋征收与补偿条例》第二十五条房屋征收部门与被征收人依照本条例的规定，就补偿方式、补偿金额和支付期限、用于产权调换房屋的地点和面积、搬迁费、临时安置费或者周转用房、停产停业损失、搬迁期限、过渡方式和过渡期限等事项，订立补偿协议。
