首先要知道电压高低对跑胶的影响,才能决定快慢嘛
电压高低是相对的,胶才是本质,电压过高会因为发热导致胶融化,跑太长时间marker会跑出去,甚至污染电解液

如果电压相同,你配08%的胶肯定比配12%要跑的快嘛
还有就是用途了,是分离样品还是就观察条带,后者就可以跑快点嘛,有没有东西一看就知道了
(快速跑胶秘籍:Quick and dirty method)
把装胶的溶液槽置于冰盒内跑,使冰块包围着装置。看条带的话140V,15min搞定,注意装置一定要保持水平!
PS:师姐一般都比较保守,有问题当然要问师兄的哇,然后才好教师妹,是吧
生物学实验--电泳
琼脂糖凝胶电泳是用琼脂糖作支持介质的一种电泳方法。其分析原理与其他支持物电泳的最主要区别是:它兼有“分子筛”和“电泳”的双重作用。琼脂糖凝胶具有网络结构,物质分子通过时会受到阻力,大分子物质在涌动时受到的阻力大,因此在凝胶电泳中,带电颗粒的分离不仅取决于净电荷的性质和数量,而且还取决于分子大小,这就大大提高了分辨能力。DNA分子在高于等电点的pH溶液中带负电荷,因此在电场中向正极移动。
影响因素的话,DNA的长度,结构,胶的浓度,电压等会对电泳造成影响。
电泳速度与DNA构象的关系
质粒DNA通常具有三种不同的构象:共价闭合环状(超螺旋)、线型、开环型(环状)琼脂糖凝胶电泳时,一般共价闭合环状的迁移速度最快,其次为线状分子,开环型分子最慢。
核酸分子大小与琼脂糖浓度范围的对应关系
分子量大的核酸电泳时使用浓度较小的凝胶,分子量小的核酸电泳时使用浓度较大的凝胶。核酸在浓度越大的凝胶中电泳速度越小。如果胶浓度偏高,可能跑不动,如果胶浓度偏低,可能跑得太快,分不开。
凝胶浓度(%) 线性DNA长度(bp)

05 1000~30000 07 800~12000 10 500~10000
12 400~7000 15 200~3000 20 50~2000
注意:核酸染料有毒,具有致癌性,注意保护自己。
电压关系
电压过高会因为发热导致胶融化,跑太长时间marker会跑出去,甚至污染电解液。电压看电泳槽多大,两电极之间的距离,每cm 3~5V。例如一个20cm的电泳槽,电压就应该设为60~100V间。电压大,速度就快。
拖尾
marker拖尾是因为缓冲液要换了或者缓冲液太少了没有盖住胶。
菌落PCR

1 设计引物很关键。一般如果是定向克隆,用载体上的通用引物即可;如pET系列可用T7通用引物。如果是非定向克隆(如单酶切或平末端连接),一条引物用载体,一条引物用目的基因上的,这样就可以比较方便的鉴定了,而且错误概率很低。PCR条件的选择接近最佳,同时挑取的菌体不宜太多,否则会有非特异性扩增。
2 使用的引物浓度不能太高,浓度过高会导致非特异性扩增,反应的循环数也不能太多,一般不超过25个。同时因为扩增的片段的GC含量问题,有的GC含量很低,有的又很高,导致菌落PCR不容易扩增出目的条带,在此建议在设置PCR程序时以高GC的温度为上限,每一循环降02度左右。
退火温度是当50%的引物和模板表现为双链DNA分子时的温度在理想状态下,退火温度足够低,以保证引物同目的序列有效退火, 同时还要足够高,以减少非特异性结合。合理的退火温度从55℃到70℃。退火温度一般设定比引物的 Tm低5℃。 DNA聚合酶在60-72度活性比较高。因此,退火温度是可以高于60度的。延伸的温度不要低于退火温度,一般72℃。


