有上海居住证可以办理港澳通行证的。
根据公安部的相关规定，自2016年4月1日起，在全国实施居住证制度的县级以上城市，居住证持有人，可以在居住地申办因私出入境证件。但是除了居住证，还必须满足以下条件：
1、就业人员需提交社保部门出具的在就业地连续一年以上缴纳社会保险的证明；
2、就学人员需提交就读院校出具的在学证明。
首次办理须本人至户籍所在地的出入境管理处提交申请，申请材料有：
1、居民身份证及复印件（用A4纸复印，可复印在同一张纸上）。
2、填写《中国公民出入境证件申请表》。
3、2寸淡底色彩照2张（也可现场拍照，费用自付），同时分别申请赴香港、澳门的签注。只去香港则申请香港签注，只去澳门则申请澳门签注，如果香港、澳门都去，则两地签注都要申请。
办理时限自受理之日起10个工作日（首次或非首次申请）。但均不含邮递日（一般在五天左右）以及节假日。
费用《往来港澳通行证》每本80元；一次往来签注，每个15元，二次往来签注，每个30元。
往来港澳通行证
上海办理港澳通行证地点
办港澳通行证需要的证件和材料如下：
身份证原件及复印件； 户口簿原件及复印件； 复印件为A4规格（身份证需要复印正反面，户口簿需要复印户主页，和你所在的那一页）； 二寸正面免冠平面彩色近照，蓝色背景，着深色有领上衣，照片大小48X33mm头部宽度21-24mm头部长度28-33mm（必须在公安局指定的照相馆拍照，也可以在出入境拍照，记得拿照相回执，建议在出入境拍照）。
往来港澳通行证，俗称双程证，是由我国出入境管理局（即国家移民管理局，一个机构两块牌子）?[ 签发给中国内地居民因私往来香港或澳门地区旅游、探亲、从事商务、培训、就业、留学等非公务活动的旅行证件。 通行证分为个人旅游、团队旅游、探亲、商务、其他、逗留等种类。
全国通办
2019年4月1日起，往来港澳通行证、往来台湾通行证等出入境证件实行“全国通办”，即内地居民可在全国任一出入境管理窗口申请办理出入境证件，申办手续与户籍地一致。此外，申请人异地申办赴港澳台团队旅游签注，还可在自助签注机上办理，立等可取。
出入境证件实行“全国通办”后，可以实现三个“都能办”：全国各地都能办，即内地居民可在全国任一出入境管理窗口申办出入境证件，申请材料与户籍地一致；内地居民都能办，即不受户籍地、居住地等条件限制，内地居民均可在异地申办出入境证件；出国出境证件都能办，往来港澳通行证、往来台湾通行证等都可在异地申办。
法律分析：根据法律规定，上海市户籍的居民可以到上海市各县区的公安局出入境管理部门申请办理港澳通行证。
法律依据：《中国公民因私事往来香港地区或者澳门地区的暂行管理办法》
第六条 内地公民因私事前往香港、澳门，须向户口所在地的市、县公安局出入境管理部门提出申请。
第九条 内地公民因私事申请前往香港、澳门，须回答有关询问并履行下列手续：
（一）交验户口簿或者其他户籍证明。
（二）填写申请表；
（三）提交所在工作单位对申请人前往香港、澳门的意见；
（四）提交与申请事由相应的证明。
第十一条 公安机关出入境管理部门受理的前往香港、澳门的申请，应当在六十天内作出批准或者不批准的决定，通知申请人。
