＊样品制备
样品必须完全溶解于上样缓冲液，否则不能在凝胶中移动。样品太浓可能产生假相。
样品缓冲液包含盐类（维持样品）、甘油（增加重量从而使样品下沉至点样孔）、以及示踪染料（以便监测电泳进程）。
样品缓冲液可以分装成小部分冻存。
缓冲液加到凝胶上之后才能点样。
样品缓冲液中的示踪染料可以指示什么时候终止电泳。两种最常用的染料是漠酚蓝(BPB) 与二甲基苯青FF 。
＊标准分子质量
标准分子质量应同时电泳，用来检测电泳进展以及分析结果。
使用相适应的标准分子质量。
胶连同分子质量标准物一起拍照。标上各条带的大小。
标准分子质量有带标记的与不带标记的两种。标记可以是荧光、发光体或者放射性元素。如果手边没有带标记的标准物，可以将染色后的胶与事后标记的印迹相比较。
在每一块胶的同一泳道点上标准物。把标准物加在第一个泳道，就能知道胶的方向。
点上正对照与负对照。
＊样式
琼脂糖凝胶一般以水平方向进行电泳，而聚丙烯酰胺凝胶则是以垂直方向进行电泳。潜水型胶是一种水平方向胶，凝胶被浸淹在电泳槽的底部。
凝胶可以制成多种大小。测序胶必须制成大胶，但是对于大多筛选与转移用胶，甚至包括双向凝胶来说，只要不是把分子量相近的条带区分割，小型胶就可以了。
毛细管电泳利用开口狭小的毛细管来进行DNA 、蛋白质和其他小分子的自动高效分离。分离是与检测分析相连，就像色谱仪器一样。只有专门实验室才有毛细管电泳设备。
＊凝胶
聚丙烯酰胺VS
琼脂糖。尽管凝胶电泳可以在滤纸、醋酸纤维素、淀粉或者其他基质上进行，大多数研究者还是只采用聚丙烯酰胺或琼脂糖凝胶。两种都是多孔性胶，像分子筛样起作用（聚丙烯酰胺或者琼脂糖的百分比越高孔越小）。理论上，任何一种都可以用来分离DNA
、RNA 或者蛋白质。但是，聚丙烯酰胺在低百分比浓度时很软，难以用手操作。一般采用高百分比浓度，用以分析蛋白质和小核苷酸。
低百分比琼脂糖凝胶相对较硬，易于操作，用来分离目的分子，如DNA和RNA或者巨大的蛋白质和蛋白质复体。
胶的浓度必须与片断大小相适应。
每次切去胶的同一小角。这样，万一胶掉落、翻转或在转移过程中放置凝胶，都能给定位做参考。
＊缓冲液
大多数电泳缓冲液配成高浓度母液，在电泳前稀释。
每一种缓冲液在某一电流时会有特定的电压。要认识每一种缓冲液的特性，这样，出错时，就马上可以注意到。
＊电源
电源输出有几种模式：稳压(mV) 、稳流（安培，或者简称安）以及稳功率（瓦特，瓦） 。许多型号允许设定程序，在各种模式之间自动转换。这样可以使用最佳的电压（ 在电泳过程中可能发生变化）同时不超出容量。
不是所有的电源输出装置都相同，所以不能简单地将电泳装置接到任意装置上。要清楚你需要什么电流或者电压，然后找出需要的装置。
大多数实验室都有不止一个电源装置用于测序胶（要求高电压）、电泳转移（要求高电流）以及用于琼脂糖和聚丙烯酰胺电泳（使用大范围的电压）的装置。很少有电源装置能同时满足所有的要求。
变性蛋白胶与DNA和RNA胶中的样品会从负极（阴极）移到正极（阳极） 。用红色导线接正极（＋），黑色导线接负极（一）。可以用同一个电源输出装置同时进行几块胶的电泳，但是没问过其他人前不要这样做，因为电泳条件会发生变化。
设置闹钟提醒自己察看胶。特别是当你要察看低分子质量的分子时，样品很容易跑出胶进入缓冲液中。
接触任何东西前，确信电泳装置必须处于断电状态。如果电源没被切断，不要进行任何操作！
电流效应
电流（mA）效应
交流电直流电
≤15没有感觉
1~8?电击感觉， 不疼
8~15?疼痛性电击，个别人可以摆脱紧握
15~2075肌肉控制丧失，不能摆脱紧握
20~50?肌肉收缩，呼吸困难
50~100300~500可能会出现心室纤维颤动
100~200?心室纤维颤动
≥200?严重灼伤，肌肉收缩严重以致心跳停止
＊固定
凝胶是否需要固定取决于用途。需要染色的胶一般需要固定，而用于转移的胶则不需要固定。
＊干燥
通过出去胶上的水，胶基质变薄。干燥之后的胶在放射自显影后条带更清晰。
在凝胶干燥仪上干燥一块胶不需1小时。凝胶干燥仪可以加热，从而加快干燥过程。
＊染色
DNA与RNA的染色可以通过在电泳前把染料加到样品中完成，也可以在事后染色。
蛋白质胶在电泳后染色。
＊记录
凝胶经溴化乙锭染色后的Polaroid照片与蛋白质凝胶的35 mm照片是最常用的记录方式。
数字记录与分析系统最常使用，所有数据可以直接用来演示。
各种转移的记录方式取决于体系与实验。例如，放射自显影与化学发光结果可以记录在X射线胶片上，而信号可用光密度计定量。
＊确定分子质量
蛋白质的分子质量可用SDS-PAGE确定，而DNA与RNA的分子质量可以由琼脂糖凝胶电泳来确定。对某一分子而言，其分子质量的对数与其Rf（相对迁移距离）存在线性关系。以标准物的迁移距离对其分子质量的对数作图，得到标准曲线，而样品的Rf 值一也就是分子质量一可以由图外推得到。
1.制胶，胶的浓度应最适宜分离分子质量相近的分子。同时电泳分子质量标准物，其范围涵盖有目的分子的大致大小。
2.跑胶，防止染料前沿跑出胶的边际。
3.胶染色，拍照。如果样品是放射性标记的，你可以使用放射性标记的标准物或者把胶与放射自显影胶片相比较。4.测定从样品孔到每一标准条带的距离。计算每个数值的对数，画到常规图纸的Y 轴上。X 轴上是迁移的距离（以厘米计最方便）。对大多数标准物条带应该得到一条盲线。
5.把样品迁移距离画到图上。外推标准曲线，确定分子质量。
几个可能, 一, 如果露铜且铜面已经变色可能是, 活化剂铜离子过高, 2. 化学镍安定剂过高, 化学镍安定剂会随高温加热分解, 所以化学镍补充剂中会含有比开缸成份稍高的安定剂, 如果补充剂一次补充过多, 也就是安定剂并没有随预期分解, 就会造成跳镀. 此外, 如果镀液漏掉了(如 管路洩漏等), 也不能以补充剂加, 要计算漏掉的体积在依比例添加开缸剂. 这是最常见的跳镀原因, 也是我之前遇过的切身之痛, 发生时会集中在一个时段, 大概一, 二个小时後就改善了, 因为安定剂会随加热及时间慢慢消耗. 二, 如果铜面没变色, 甚至是在同一线路上有部分镀上, 部分镀不上, 就是防焊漆scum残留. 三, 如果是是在防焊漆塞孔或盲孔上的pad边缘度不好(成白雾状), 有可能前处里要水没洗净, 要水残留在孔内, 影响化学镍反应. 要以超音波或震汤方式加强水洗改善. 属於化镍金制程问题, 不是防焊问题的话, 反工补救可以#600-1200尼龙轮轻刷, 小心不要把防焊漆刷坏了, 让已镀上的金面有点刷到且不要露镍; 上挂後活化, 水洗後马上重新化镍即可.
