在养殖场规划布局和建设过程中，应坚持“三个分离”的基本原则，切实考虑净化环境和推行生态健康养殖。
（1）场区布局应坚持净（道）污（道）分离原则。净道只供人、车、料的通行，污道作为病畜禽和出粪的通道。
（2）坚持雨（水）污（水）分离原则。让雨水进入蓄水塘，不得放任自流落入污水处理池，否则，就会加大处理成本和环境压力。
（3）坚持雨（水）固（态）液（态）分离原则。小区内清洁道和污染道分离，互不交叉，污水粪便处理设施和病死畜禽焚烧炉应按夏季主导风向设在生产区的下风向或侧风向处。畜禽养殖小区采取固液分离和雨污分离，污水要通过多级沉淀过滤或氧化（厌氧、好氧）处理，达到国家排放标准。液态粪污要通过沼气池处理，固态制成有机肥。小区要建绿化带和人工绿地，做到畜禽舍整齐，环境优美。
病死动物的无害化处理，一直是社会各界关注的热点问题。目前，对动物尸体进行处理的常见方法有掩埋处理法、焚化处理法、化尸井处理法、化制法、生物发酵法和堆肥法等。(1)掩埋处理法是按照相关规定，将动物尸体及相关动物产品投人化尸窖或掩埋坑中并覆盖、消毒，发酵或分解动物尸体及相关动物产品的方法。本法不适用于患有炭疽等芽孢杆菌类疫病的动物，而且掩埋深浅问题容易造成土壤、地下水污染，掩埋基地处理程序繁杂。掩埋法是小型畜禽养殖场（户、小区）处理病死动物采用的办法。(2) 焚化处理法是在焚烧容器内，使动物尸体及相关动物产品在富氧或无氧条件下进行氧化反应或热解反应的方法。对发生疫情的病死动物一般采用此方法。焚化法会产生浓烟、臭味，严重污染环境，同时收集运送又容易传染疾病，所需燃料费用成本高。(3) 化尸井处理法是利用建立的化尸窖，将动物尸体投人化尸窖并消毒，发酵或分解动物尸体及相关动物产品的方法，但化尸井处理法会产生恶臭、血水，容易造成地下水源污染及滋生病媒破坏土壤，处理所需时间长。(4) 化制法是指在密闭的高压容器内，通过向容器夹层或容器通入高温饱和蒸汽，在干热、压力或高温、压力的作用下，处理动物尸体及相关动物产品的方法。此技术在应用过程中存在安全性问题。(5) 生物发酵法将病死畜禽投进沼气池、化粪池，利用生物发酵的方法进行无害化处理。大中型规模养殖场一般采用此法。(6) 堆肥法是将病死畜禽、垫草、秸秆和水按照一定比例在一定的条件下进行堆肥发酵处理。堆肥法具有以下优点：能够生产出颇有价值的产品——肥料，这种肥料是一种无臭的、有弹性的、类似于腐殖质的物质，可以用于土壤调节，作为园艺用土；可以消灭疫病，生物安全性增加；不产生臭气和污水，有利于保护环境；需要较少的劳动力。
