《萤火虫之墓》作为吉卜力动画工作室的一部备受关注的动画，受到的是人们褒贬不一的评价。
动画主要讲了在日本兄妹二人在，受到空袭后母亲去世，哥哥清太和妹妹节子相依为命的故事。这里的两个主人公都是未成年的孩子，他们经历了战争带来的贫穷、饥饿、荒乱和人性的考验。最后双双走向死亡。
这部饱受争议的动画片中，主要的负面评价有以下几种：第一是这部影片是由日本公司制作的一部关于反战题材的动画；第二是因为动画中的哥哥清太没有努力照顾自己和妹妹；第三是这部动画反映出丑陋的人性，不应该给孩子们看；第四是这部作品是关于二战中的日本，这部动画却将日本包装成受害者的样子。
首先来说第一个问题，就是制作方式日本人。但是不论是什么国家，什么身份，对于战争这件事，都应该持有反对态度，不论制作者是什么身份，只要将战争的残酷展示给观众，让其有所反思，就是一件值得尊重的事。
其次动画中的哥哥清太没有努力照顾妹妹。试问一个14岁的孩子，没有父母可以依靠而且当时战争频发，他有什么方法能照顾好妹妹呢？有人说他不应该去阿姨家寄人篱下，可是战争频发，他们两个还没有成年的孩子要怎样才能独自生活呢？还有人说哥哥在和妹妹躲进山洞后，不应该玩得那么开心。可是哥哥也是一个孩子，在自认为找到避难所后，他和妹妹不应该高兴吗？
第三是这部动画中反应出的人性不应该给孩子看，但是孩子也许看见的不是人性问题，更多的是故事情节。但是谁又说这部动画一定要给孩子看？动画也可以是成人看的，成年人看见这部动画想到的是战争的苦、想到的是人性的恶，也会是对两个孩子的心疼和怜悯。
最后是动画将日本也包装成战争的受害者。不可否认日本在二战中所犯下的罪行是不可饶恕的，但是哪一个平民不是战争的受害者？就像美国文化人类学家鲁思·本尼迪克特在《菊与刀》这本书中写的一样，日本人所受的武士道精神的熏陶在他们的角度没有错。错的是发动战争的侵略者。
尽管这是一部动画，但是所反映出的内容却需要看官去冷静的思考，“一千个人的心中有一千个哈姆雷特”，对于本部动画的评价具有差异性才能说明每一个人都不是复制品，可以独立存在，但是不站在世间大义，而从个人的角度出发，这部动画还是值得一看的。战争带来的伤害、人性的冷暖，总会让观看者想到一些什么。
