1911年中华民国成立后,京奉铁路改称北宁铁路,由北洋政府交通部管辖。1928年6月4日,奉系军阀张作霖撤回奉天时,在北宁铁路皇姑屯站被炸身亡,史称皇姑屯事件。同年6月15日,南京国民政府宣布完成北伐,并将北京改名北平,北宁铁路也改称平奉铁路。1929年4月15日,南京国民政府铁道部再次将平奉铁路改称北宁铁路。九一八事变发生后,日军控制了北宁铁路关外(山海关以北)。七七事变后,北宁铁路全线被日军控制。

1949年10月,中华人民共和国成立,北宁铁路改称京沈铁路,后正式与原南满铁路哈尔滨至沈阳段合并为京哈铁路。


