1、决斗城市 上篇（52集~97集）
剧情简介：暗游戏在美术馆看见了一块刻有自己、海马、青眼白龙、黑魔导的古埃及石板，意识到了自己之所以不知道自己是谁的原因，即为自己的记忆在三千年前也随着自己的灵魂被封印了，他决定寻找自己遗失的最重要的记忆，而这个方法就是集齐由帕加索斯创作的“三幻神”卡。
另一边，守墓一族的传人马利克为了向法老王复仇，组建了稀有卡狩猎集团“古鲁斯”。他的姐姐伊西丝·伊修达尔为了阻止自己的弟弟对法老王展开的复仇；
将“三幻神”中的“欧贝利斯克的巨神兵”交给海马，希望他能利用海马集团的力量引出马利克并阻止他的阴谋。海马为了从游戏处夺回“决斗王”的称号，在童实野市举办“决斗都市”大赛。
2、决斗城市 下篇（122集~142集）
剧情简介：暗游戏与城之内克也等人都参加了比赛。暗游戏击败了使用盗版“艾克佐迪亚”的猎人 和同样使用“黑魔术师”的魔术师潘多拉，其后在马利克主要人格操控的默剧演员手中夺得了“奥西里斯的天空龙”，并且与海马联手击败了前来袭击的数名“古鲁斯”猎人。
但城之内克也被马利克控制，在码头中强迫暗游戏进行决斗。表游戏不忍暗游戏与城之内自相残杀，愿意牺牲自己让城之内获胜。最后城之内恢复理智，成功将游戏解救出来。“决斗都市”的8强比赛改为在海马集团的飞艇上进行。
暗游戏首先用“奥西里斯的天空龙”击败了暗貘良。在4强比赛中，游戏击败了海马，海马将“欧贝利斯克的巨神兵”与“恶魔的圣域”交给了游戏。决战中与马利克黑暗人格操控的“太阳神的翼神龙”展开了激斗，太阳神被击败后，马利克的主要人格和黑暗人格交换，主要人格投降消灭黑暗人格，游戏胜利，得到太阳神，“三幻神”齐集。
扩展资料：
战斗城市篇登场人物——
1、阿图姆
阿图姆，主角之一，被武藤游戏称为“另一个我”，精通世界上所有的游戏，是游戏进行卡片决斗时的主要人格，也是推动剧情的核心人物，在本篇中，阿图姆参加了“战斗城市”大赛，在这场比赛中，与马利克领衔的古鲁斯集团、宿敌海马、逆袭的暗貘良等各方势力展开了激斗， 最终捍卫了“决斗王”之称号，也集齐了三幻神。
2、武藤游戏
武藤游戏，本是一名普通的中学生，非常喜欢玩游戏。由于身材矮小，在学校常受人欺负。在拼成了千年积木后，他的心中出现了另一个自己（暗游戏）代替其决斗，并凭着自己的真诚与善良交到了知心的朋友。表面看上去弱小又敏感，实际内心却暗藏了令人意想不到的爆发力。
3、马利克·伊修达尔
马利克·伊修达尔，重要反派角色，他是守墓一族传人，为了向暗游戏复仇而参加战斗城市比赛，持有最强神之卡太阳神之翼神龙。在本篇中，由于暗人格觉醒时，主人格的马利克并不知道其间发生的事；而在随后现身的夏迪一言，认定是无名的法老王“暗游戏”所导致的。为了向无名的法老王复仇，决心成为新的法老王；成立了葛鲁兹。
KEY会社是ビジュアルアーツ（VisualArt's）旗下的一个品牌，它位于日本大阪市的一所游戏制作公司，以制作感人的AVG(电子小说类游戏)而著称于业界。Key最著名的四季四部曲---春之《Clannad》、夏之《Air》、秋之《One》（原制作公司为Tactic，但制作班底主要是后来加入Key会社的制作人员）、冬之《Kanon》。Key的游戏剧情充满幻想与温情，其充满张力的剧情总是能令人感动得泪流不止，也正因为如此，Key的游戏都被称作为泣きゲー（令人哭泣的游戏）。由于Key也被叫做“键”，因此在爱好者人群中，Key与Leaf（“叶”）常常并称为“键叶”或“叶键”（网上主要使用后者）。而Key迷则被称作是“键っ子”。
ONE～辉く季节へ～（OVA，分全年龄的4集和非全年龄的3集两种版本）简介：折原浩平（ONE的男主角）青梅竹马的玩伴。折原浩平的妹妹みさお去世时，浩平搬到了瑞佳（女一号）的隔壁。那时，因为妹妹的死，浩平非常自闭，自己一人呆在屋子里。隔壁的小瑞佳并不知情，常常安慰独自哭泣的浩平，并找他出去玩。那时，年幼的浩平已经把“幼时的瑞佳”作为自己死去的妹妹的替身了。为了履行和记忆中妹妹的『永恒的誓约』，浩平只允许和みさお在一起，不能和其他的女孩在一起。但是，浩平一次玩笑性的表白打破了一直以来两人的玩伴关系。这也注定了折原浩平消失在永恒的世界的悲剧……
