合法改造发动机的办法：1、已注册机动车在机动车所有人住所所在车辆管理辖区内移动或者变更机动车所有人姓名（单位名称）及****时，应当向注册地车辆管理部门备案。2、机动车所有人在车辆管理辖区内流动或姓名（单位名称）变更时，应当提交身份证、机动车登记证明、行驶证以及相关变更证明。车辆管理部门应当自受理之日起一日内，在机动车登记证书上填写备案事项，并办理补办行驶证。3、机动车所有人****变更时，应当提交身份证和行驶证。车辆管理部门应当自受理之日起一日内进行备案。
根据现行的《机动车登记规定》相关条款，改变已领牌照机动车的车身颜色、车型、性能、用途和结构，更换车架、车身或发动机，车主都必须向车管所申请变更登记。加装尾翼、做大包围、改装排气管等行为，原则上都不被允许。
国家关于汽车改装的有关规定：
有下列情形之一的，不予办理变更登记：
（一）改变机动车的品牌、型号和发动机型号的，但经国务院机动车产品主管部门许可选装的发动机除外；
（二）改变已登记的机动车外形和有关技术数据的，但法律、法规和国家强制性标准另有规定的除外。
