不提倡对青蛙养殖池水用消毒的方法保洁。药物控制病菌始终是辅助手段而不应当作为主要依靠的手段。养殖的重点在当地可取得的自然水量前提下确定合适的养殖密度。而不是先人为选择一个养殖密度，然后考虑用药物控制污染。实际上，过高的密度本身就会引起蛙的应激反应，用药物根本控制不了蛙的免疫力下降，生长缓慢，疾病频发而死亡不断，因为致死的根本原因并不是病菌而是环境。
任何一种消毒剂都是有针对性的。所以要看你主要想针对何种致病菌。并不存在一种消毒剂就能应对任何致病菌。最典型防疫消毒剂建议是二氧化氯、聚维酮碘。前者主要针对蛙类非出血性炎症，后者针对出血性疾病。
蛙类池水污染主要的污染源是蛙尿、蛙粪。它也是所有致病菌的“培养基”也因此，任何消毒剂都无法阻止强粪便污染的池水中致病菌的发展，对此只有更换水体降低污染浓度才是正确的措施，有些地方利用植物吸收，也有的地方用石灰中和等等都是降解粪便污染的途径，同时要强调提醒的是：任何消毒剂都无法消除粪便污染的。
