1.制造成本和维修成本都高于普通四缸发动机。由于排量小、产量高，同时需要解决非对称结构引起的强烈振动问题，因此需要采用许多新技术。这使得发动机的维修成本也相应地提高了。2.不平衡的工作条件更容易引起振动。因为气缸数量在两侧不相等，这在工作中更容易产生颤抖和振动，发动机声音也会更大。尽管采用了平衡轴技术来缓解振动问题，但仍高于四缸和六缸发动机的振动水平。3.进气量较小，主要优势在于起步加速性能。相比四缸发动机，由于少了一缸，进气量也更小，这限制了起步阶段的加速表现。对于那些注重动力性能的车主来说，这可能是无法接受的。
涡轮增压发动机缺点：1、增压后，发动机在工作时的压力和温度都大大提高，因此发动机的寿命会比相同排量的发动机不增压要短，并且机械性能、润滑性能也会受到影响；2、除去涡轮迟滞，就是加油之后不是马上发动机就能马上出力，而是存在一定的滞后，这随涡轮的尺寸而变化，涡轮的滞后越大，越明显；3、由于低速涡轮的干预效果有限，所以一般驾驶涡轮车起步可以一开始就把发动机转速提高到涡轮的工作转速附近4500RPM然后再开始挂挡；4、这款发动机后期的维修或者保养都是比一般的发动机要贵一些的。
