阿克苏市境野生动物中，哺乳纲有7目，18科，3亚科，66种；鸟纲有19目，42科，4个科，约200种。随着人口增加，大面积垦荒造田，栖息地减少，野生动物有逐渐减少的趋势。
兽类主要有马鹿、兔狲、鹅喉羚（黄羊）、赤狐。其他兽类有野猪、狼、草兔、塔里木兔、河狸、大耳猥、蝙蝠、扫雪、伶鼬、香鼬、草原斑猫、大耳鼠兔、帕氏鼠兔、拉达克鼠兔、黄鼠、沙黄鼠、旱獭、跳鼠、象鼠、仓鼠。
禽类主要有黄毛喜鹊、柳莺、鹌鹑、鹰、环颈雉（野鸡）。中日候鸟保护协定鸟类有大天鹅、小天鹅、赤麻鸭、绿头鸭、潜鸭、黄鸭、角百灵。其他禽类有猫头鹰、啄木鸟、金黄鹂、山斑鸠、鹭鸶、小海鸥、斑头雁、鹞、秧鸡、野鸽、家燕、黑雨燕、沙百灵、云雀、掠鸟、乌鸦、地鸦、稻田苇莺、树麻雀、象麻雀、沙雀、漠雀。
鱼类当地经济鱼类有塔里木裂腹鱼（夹嘴）、扁吻鱼（大头鱼）两种，小杂鱼有条鳅1种。引进鱼类有青、草、鲢、鳙（四大家鱼）和鲤、鲫、鳊、鲂等养殖鱼类。外地自然现象带入的小型杂鱼有麦穗鱼、棒花等鱼。
两栖与爬行类有蟾蜍、牛蛙、蜥蜴、林蛙、沙蜥;虫类有蜜蜂、蚂蚱、马蜂、蝼蛄、蜘蛛、水蛭、螳螂、潮虫、蚂蚁、蝴蝶、蜻蜓、萤火虫、蝎、虻、蠓。 阿克苏市境的野生植物，经调查采集整理的标本共有51科、232属、497种。木本主要有胡杨、灰叶胡杨、白榆、沙枣、沙棘、柽柳（毛柽柳、多枝柽柳、垂枝柽柳）、野刺玫、大叶白麻等。
草本主要有芦苇、蒲草、芨芨草、碱蓬、碱茅、裸果木、铁线莲、水葫芦、草木樨、黄花苜蓿（野苜蓿）、帚状委棱草、芝麻菜、独行菜、荠菜、海乳草、点地梅、报春、荒漠栖草、北方拉拉藤、羊角芹、草原糙苏、浦散亚菊、紫缨乳菊、蒿、银穗草、新疆早熟禾、鹅观草、牛毛毡、苔草、野韭菜、多叶葱、马莲。
药材主要有甘草、党参、大芸、麻黄、阿魏、当归、羌活、赤芍、板蓝根、黄芪、大黄、列当、罗布麻、龙胆、苍紫草、乌头、锁阳、贝母、车前、枸杞、青兰、蓟、蒲公英、菟丝子、红花。
新疆骆驼养殖国外研究现状：
1、基本上新疆各县市都有骆驼，这在全国是独一无二的。
2、新疆骆驼主要分布在阿勒泰、塔城、伊犁州、阿克苏、克州、和田、哈密、乌鲁木齐市周边、昌吉州等地区，占新疆骆驼总量的94.6%。
3、近些年，除16、17年出现低谷外，新疆骆驼养殖数量始终处于领先地位。
