截至2019，已有东南大学、南京航空航天大学、河海大学、中国药科大学、南京医科大学、南京工程学院、南京晓庄学院、金陵科技学院、南京邮电大学、中国传媒大学南广学院、江苏海事职业技术学院、金陵协和神学院?、南京交通职业技术学院、南京旅游职业学院、江苏经贸职业技术学院、正德学院等院校入驻。
1、东南大学
2006年夏季起，东南大学主教学区迁至东南大学九龙湖校区，总面积3752.35亩。
九龙湖校区建筑规划以东南大学的历史文脉为依据，采取公共核心教学组团与专业教学族群组团相结合的校园建筑形态九龙湖校区已建成教学区、科研实验区、行政区、本科生生活区、研究生生活区、教师生活区、后勤保卫区等，总建筑面积约59.9万平方米。
2、南京航空航天大学
学校前身是1952年10月以511厂为基础创建的南京航空工业专科学校，是中华人民共和国创办的第一批航空高等院校之一；1978年，被国务院确定为全国重点大学；
1981年，经国务院批准成为全国首批具有博士学位授予权的高校；2012年12月，工业和信息化部、中国民用航空局签署协议共建南京航空航天大学。2018年12月，工业和信息化部、教育部、江苏省共建南京航空航天大学。
3、中国药科大学
学校前身系创建于1936年国立药学专科学校（本科四年制），是中国历史上第一所由国家创办的高等药学学府。1952年，齐鲁大学药学系和东吴大学药学专修科并入学校，成立华东药学院。
1955年开始招收研究生。1956年更名为南京药学院。1986年与筹建中的南京中药学院合并，成立中国药科大学。
4、南京医科大学
南京医科大学创建于1934年，时名江苏省立医政学院。1957年，由镇江迁至南京，更名为南京医学院。1962年，被列为全国首批六年制医药院校。
1981年，被批准为全国首批博士、硕士学位授予单位。1993年，更名为南京医科大学。2015年9月，获准成为首批教育部、国家卫生计生委与省政府共建医学院校。
5、南京邮电大学
学校前身是1942年创办于山东抗日根据地的“战时邮务总局干部训练班”，历经“战邮”学校、山东大学邮电专科部、华东邮电学校等阶段，1958年经国务院批准改建为本科高校，取名南京邮电学院，2005年4月更名为南京邮电大学。
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