首先在养殖水方面必须保证有良好的水质，由于秋季是锦鲤生长的旺季，大量喂食，排泌物相对增多，非常容易造成水质的变坏（悬浮粒子增加，水体混浊，氨氮、亚硝酸盐增加）。因此要求多排底水，勤于换水。购买新鱼时尽可能购进健康的鱼。同时做好转水同温的工作。
一年内曾经进鱼的，有必要在开春和初秋做一次全池（全缸）杀虫杀菌预防工作。近来购进或准备购进的新鱼必须做好检疫工作，有条件的隔离暂养20-30日，并同时进行常规的杀虫杀菌。
杀虫杀菌方法：用水产养殖、观赏鱼类的专用杀虫剂。杀虫（例如阿维菌素、溴氰菊脂、敌百虫、水产专用杀虫剂等，其具体用量与操作细看说明），24小时后换水1/5，然后使用杀菌剂杀菌（
例如二氧化氯、强氯精、溴氯海因、高聚碘、络合碘、黄粉、缸养杀菌剂等，其具体用量与操作细看说明，并要求准确计量及购买知名厂商的药品），氯制剂24小时后再放一次，碘制剂48小时后再放一次。两次杀菌之间换水1/5。最后在距离第一次杀虫7天再杀虫一次,必要时过二至三天后使用指环净（甲苯咪唑）杀指环虫（多数引致烂鳃的罪魁祸首），一次或两次（48小时后才换水）。
新进鱼没办法隔离只能放大池检疫，其杀虫杀菌步骤及方法基本相同，水温18度以上可进行一系列操作。要求整个操作过程必须保证养殖水有足够的含氧量。
方法与步骤：
杀虫24小时换水1/5杀菌24小时或48小时换水1/5杀菌距离第一次杀虫七天杀虫。
若发现有原虫感染的，先用原虫净（硫酸锌）、孔雀石绿或甲基蓝等杀原虫，24小时后才进行上述的一系列操作（进了新鱼的有必要这杀原虫操作，特别是水温低时）。
我从2012年重建池开始饲养锦鲤起，每年都按照上面的步奏进行杀虫杀菌工作，全池鱼基本上都很健康的生长（2012年曾经一次用药不当，损失了一部分爱鲤之外）。饲养锦鲤也需要科学饲养，学习鱼友们的饲养经验，这样才能让她们健康生长。
水产养殖过程中，有些药品的使用是需要一定规范与注意事项的，并非一种药品能够适用于所有品种，用药也要考虑到天气、水温、水深等各种因素。近日气温回暖，正要进入正式的养殖阶段。因此小鱼为大家分享药品的用药禁忌，希望各位经销商、养殖户能在新的一年里，不出现用药事故、卖鱼赚钱多多！
1、甲苯咪唑溶液：按正常用量，胭脂鱼发生死亡；淡水白鲳、斑点叉尾鮰敏感；各种贝类敏感。无鳞鱼慎用。
2、菊酯类杀虫药：水质清瘦，水温低时（特别是20℃以下），对鲢、鳙、鲫鱼毒性大；如沿池塘边泼洒或稀释倍数较低时，会造成鲫鱼或鲢鳙鱼死亡。虾蟹禁用。
?3、含氯、溴消毒剂：当水温高于25℃时，按正常用量将含氯、溴消毒剂用于河蟹，会造成河蟹死亡（在室内做试验，则河蟹不会死亡），死亡概率在20－30％。在水质肥沃使用，会导致缺氧泛塘。
4、杀虫药（敌百虫除外）或硫酸铜：当水深高于2米，如按面积及水深计算水体药品用量，并且一次性使用，会造成鱼类死亡，概率超过10％。
5、外用消毒、杀虫药：早春，特别是北方，鱼体质较差，按正常用量用药，会造成鱼类死亡，特别是鲤鱼死亡，概率5－10％，且一旦造成死亡，损失极大。对患有肝胆综合症以及其它内脏疾病的鱼类，降低用药量，否则会造成鱼类的死亡。
6、阿维菌素溶液：按正常用量或稍微加量或稀释倍数较低或泼洒不均匀，会造成鲢和鲫鱼的死亡。海水贝类在泼洒不均匀的情况下，易导致贝类死亡。
