医院设二个住院病区及中医伤科、西医骨科及骨伤专家门诊等10余个临床科室。病房以高级宾馆式标准配备。设备精良，技术力量雄厚，年门诊量3万人次，住院病人2000余多人次，开展手术800余台。拥有美国GE公司原装进口全身螺旋CT、日本柯尼卡X线成像系统（CR）、500MAX线机、西门子B型超声波、全自动生化分析仪、ACM麻醉机、万能进口手术床等等先进医疗设备，2007年又投资百余万元建成了舟山最先进的手术室之一：100级高标准层流净化手术室；还有新大楼中的大型中央智能空调，中心供氧系统，两组奥克斯医疗专用电梯等等，为高水平的医疗服务奠定了坚定的硬件基础。
目前医疗用房面积达6万平方米，有外科大楼、内科大楼、门诊大楼、传染病区大楼等综合医疗用房。在舟山临城新区，医院新院区占地293亩，一期门诊楼已部分运行，二期工程正在建造中，届时一个超大型的、综合性的、高水准的、现代化的海岛医疗界航母将呈现在人们眼前。
现医院拥有1.5T超导核磁共振器、西门子全身4排螺旋CT机、X—刀、全套CR/DR、西门子直线加速器、数字减影血管造影仪、800mAX光机、彩色多普勒超声诊断仪、全自动生化仪、全自动血凝仪、氩气速凝血电刀、超声刀，血细胞分离仪、流式细胞仪等大型医疗仪器和设备。配有全套内窥镜及内腔镜系列，如十二指肠镜、胆道镜、支气管镜、胸腔镜、腹腔镜、关节镜、脑室镜、椎间盘镜等。设施齐全的医技科室，精良的医疗器械和设备为临床诊断与治疗提供了有力的技术支撑。
