我个人觉得做医药超市好，其好处在于：
1、投资小，见效快，成本便于控制，风险小。作为医药超市是采购方，相对而言管理成本与难度较医院相比会低很多。
2、医药超市占地面积有限，便于选址。
3、目前的医疗体制改革陷入困境，医药超市更受百姓欢迎与认可。
4、审批手续相对较为简单。
当然做医药超市与医院相比同样有不足：
1、利润率低。
2、社会效益相对差些（如果您追求社会效益与美誉度的话）
3、成长空间有限
做医院的劣势在于：
1、医院审批手续复杂，且投资过大。
2、在形成品牌之前，短时间内难以收回投资成本。
3、就目前的体制而言，民营医院处在一个非常尴尬的地位，其盈利能力也参差不齐。
4、您可以针对当前的民营医院做一个市场调研，计算一下整体的盈利率有多高，我想如果民营企业盈利能力强的话就不会满大街发小广告了。
5、人力成本高，专业医疗人员的水平是民营医院的经营之本，然而现在专业人员的聘请较为困难且不稳定，所以目前的民营医院更多的在做专业，如男科、妇科等，而严重同质化的专业医院又缺乏核心竞争力。
综上所述，个人认为您还是做医药超市比较稳妥，如果有条件与能力的话可以同时拿下几个有前景的药品做省级或者市级代理销售作为医药超市的补充。
