消毒剂分为：
（1）碱性消毒剂 常用的碱性消毒剂主要有生石灰、草木灰、烧碱和季铵盐。用3.0%～5.0%的生石灰水溶液、1.0%～2.0%的烧碱溶液喷洒消毒鸭舍内地面、墙壁、网架结构、水槽和食槽等养殖设备及运动场等，具有良好的消毒作用。冬季北方地区在使用火碱溶液消毒时，应防止冻结而降低消毒效果。火碱溶液有强烈的腐蚀性，不应用于金属器械、纺织品的消毒。更应避免鸭群直接接触火碱溶液。草木灰与水按1∶10的比例混合均匀，制成水溶液，喷洒鸭舍、运动场，浸泡消毒水槽及食槽等，水温为50～70℃时消毒效果最好。
（2）氧化性消毒剂 主要有过氧乙酸、过氧化氢、次氯酸、高锰酸钾、碘酊、酚类、醛类（甲醛、戊二醛等）等。
0.3%～0.4%的高锰酸钾溶液可用于消毒鸭舍、运动场、水槽及食槽等。用高锰酸钾和福尔马林进行熏蒸消毒时，消毒剂量为每平方米鸭舍使用福尔马林40升、高锰酸钾20克。方法是将福尔马林迅速、轻轻倒入盛有高锰酸钾的容器中，操作人员立即离开鸭舍，关严门窗 30分钟。鸭舍温度保持在24℃以上，湿度75%以上时，熏蒸消毒效果较好。
漂白粉混悬液能有效杀灭细菌、病毒和炭疽芽孢，用于圈舍、饲槽及排泄物的消毒。使用的溶液浓度为5%。使用漂白粉混悬液消毒时，应现用现配，避免用于消毒金属器械。
在奶牛养殖中，传染病的危害非常大，为了消灭传染病，截断传播途径，通过严格消毒杀灭病原菌，是预防和控制疫病的重要手段。
1.常用的消毒药物
10%～20%的石灰乳，2%～4%氢氧化钠溶液，1%～10%的漂白粉混悬液等，但不准使用酚类消毒剂。
2.粪便消毒
常采用堆积发酵，当温度达70℃以上时，就可杀灭病原菌和寄生虫。药物杀菌，在约100千克粪便中加入15%～20%的氨水或0.5千克过磷酸钙，拌匀，放置2天左右，即可杀死大部分微生物和虫卵。
3.污水消毒
小部分污水是与粪便一起发酵，大部分污水是集中排放到蓄污池，封闭发酵。
4.场门消毒
场门口应设有消毒池，长不小于5米，池内蓄有2%氢氧化钠溶液，主要用于车辆的消毒；设有隔离室，主要对人员进行消毒。
5.牛舍的消毒
牛舍每周消毒一次，主要用2%氢氧化钠溶液喷洒，也可用石灰粉干撒。
6.场区消毒
场区保持干净整洁，定期消毒，主要用2%氢氧化钠溶液喷洒，也可用石灰粉干撒。
