深圳办理港澳通行证可以在深圳市公安局出入境管理处梅林办证大厅办理。
深圳市公安局出入境管理处梅林办证大厅的地址位于深圳福田区梅林路及凯丰路交汇处。该处可以办理往来港澳通行证的首次申请或换发、补发以及除“个人旅游”、“团队旅游”、“商务”和“夫妻探亲”再次加签以外的签注，因私护照，往来台湾通行证及签注。办理时间是周一至周五的上午09:00-12:00以及下午14:00-18:00（法定节假日除外）。
也可以携带身份证到自助大厅自行办理港澳通行证。离福田区较近的可以直接前往办公大厅办理，如离的远也可提前网上预约。到现场办理的申请人将材料提交给办理窗口，同时采集指纹，办理成功后领取回执单，到自助缴费机或缴费处进行缴费即可。
办理港澳通行证注意事项
需要注意港澳通行证的有效期和使用范围。港澳通行证的有效期为5年，但是每次入境香港或澳门的最长停留时间不得超过90天。此外，港澳通行证只适用于赴香港、澳门地区的旅游、商务、探亲等非移民目的，如果需要在港澳地区长期工作、学习或定居，需要另行办理相应的居留或签证手续。
总之，深圳户籍居民办理港澳通行证需要准备好相关材料，选择适合自己的申请方式，注意通行证的有效期和使用范围。在办理过程中，如果遇到任何问题，可以随时咨询相关部门或专业人士，以确保申请流程顺利完成。
深圳需要到深圳外事服务中心办理.
所需材料：
1．日本入境签证申请书（1份；外事服务中心网站上下载后填写，与日方出具材料完全一致）
2．亲属关系名单表（填一位即可）
3．大一寸免冠近照（1张）
4．有效护照（原则上半年有效）并护照首页复印件（1份）
5．短期商务一次签证申请理由书（由当地日资企业的负责人制作）（原件1份）
6．日资企业商工会等的会员名簿(该公司栏当页)(复印件1份)
7．「滞在予定表」（由当地日资企业的负责人制作）（1份）
8．公司营业执照（或副本）复印件,合资企业还须提交批准证书复印件（1份；盖公章）
9．申请人所属企业开具的在职证明书（原件1份；盖公章，法人签字）
10.身份证（正反面）及户口簿（所有内容页）复印件（1份；验原件）
11.居住证复印件（仅暂住人员提供 1份）
