共分三部，第一部为库洛牌篇，第二部为小樱牌篇，第三部叫《翼年代记》，是小樱他们长大后的事，但故事、背景完全不一样。
《翼年代记》：小狼是玖楼国的考古学家和小樱公主从小便是青梅竹马。多年后，经过考古的挖掘，遗迹渐渐露出，小樱本打算向小狼表白爱意，当她进入遗迹底层去找他时，遗迹突然有异样，小樱的背部突然长出一双翅膀，在遗迹中隐没，小狼冲上去抓住小樱，但翅膀上的羽毛却一根根飞散，接着她便昏迷不醒。祭司雪兔得知小樱的“羽毛”已飞散到各式各样的异世界去，那些羽毛是公主的记忆，若不赶快找回部份羽毛，小樱将会有生命危险。由于情势危急，雪兔遂私自决定把两中送到身在不同的次元世界的“次元的魔女”。在日本国，负责保护知世公主的忍者黑钢 因经常杀戮（虽然只是杀死入侵者及敌人）知世公主为了让她了解犟劲的真正意义，在他身上施咒，不准他再杀戮(咒的内容大概:如果黑钢随意杀生的话,强劲就会减少一点。)；又把他送往异世界“次元的魔女”处，希望他在旅程中学习。另一边，在色雷斯国，法伊为逃离阿修罗王的追捕，以魔力把自己送到“次元的魔女”身边。四人都抵达了“次元的魔女”侑子面前，她能实现任何人的愿望，只要付出相对的代价，就能够实现愿望
做为CLAMP大神的漫画作品，百变小樱虽然没有《东京巴比伦》的现实暗喻、没有《X战记》的场面宏大、没有《三叶草》的清丽构图唯美画风、没有《圣传》的华丽画风。但是百变小樱绝对可以称得上是绝对的成功之作。
从画风方面来说——清新的画风引领低幼化的风潮。
相对于《东京巴比伦》与《X战记》来说《魔卡少女樱》（也就是百变小樱）的画风简直清纯干净到飞起。简单的线条、明快的黑白灰关系、没有复杂的网点，整部作品看起来很流畅。
而且全部的人物造型都颇具看点，每次小樱的服装变化，都像洋娃娃一样的让人觉得可爱漂亮。而其它的配角也同样是美女帅哥的组合。这对CLAMP来说，应该是得心应手的画技展现了。必竟是以美形来扛起少女漫画一片天的作者啊。
并且整体的画风很适合低幼化的群体阅读，可以说是一部充满童年幻想的漫画。
从故事的营造方面来说——掀开一场华丽的魔法风暴。
我觉得《魔卡少女樱》这本书最大的故事成就并不是在于里面的情节，而是在于小樱层出不穷的卡牌。这个卡牌系统就像是我曾经看《机器猫》一样，那时的我对于机器猫肚兜里的东西充满幻想，现在也许很多小朋友也对于小樱的每一张新的卡牌都充满着想象。
我觉得这种想象，就是童年吧。
所以从故事的营造方面来看，《魔卡少女樱》是成功的，不但造就了无数少男少女的童年梦想，也塑造了无数经典的角色和情节。小樱、小狼、知世等都像是小朋友身边的同学一样，生活在小朋友的想象中。
从商业化角度来看——CLAMP你们就是来骗钱的无良商人！
小樱的各种手办、小可的各种玩偶、各种卡牌、动画化、游戏化、**化……我觉得CLAMP整个就是一个圈钱的高手。基本上小樱的各种商业化运作可能，都被CLAMP整到了极致。
所以这部漫画的商业化运作方面也是极为成功的。这从无数的漫画衍生品上就可以看出征兆。
从漫画的经典程度来看——新一代小朋友心中的经典。
对于曾经的我们来说，心中的经典是《圣斗士星矢》、《灌篮高手》、《机器猫》、《美少女战士》等等，但是对于现在的小朋友来说，可能就变成了《魔卡少女樱》了。
漫画或动画中充满想象力的魔法情节、华丽的画面、缤纷的道具……都成为小朋友的心中偶像。因此从经典程度来看，我觉得百变小樱也是成功的。
而一部漫画从画风、故事情节、商业化运作、经典程度四个方面都能成功的话，那么就一定是一部优秀的漫画作品了。由此可见《魔卡少女樱》这部漫画非常的优秀！
