为促进义务教育均衡发展，确保每所初中学校学生都有就读优质普通高中的机会，吴忠中学60%的公费生招生指标分配到市区各初级中学进行“指标到校”录取，所分配到各校的计划在统招线上达到录取名额的，其指标在原比例上提高4个百分点进行录取。市区部分学校考生分数低于吴忠中学录取分数线也可录取，如：吴忠一中563.0分，吴忠二中、吴忠八中、板桥中学、秦渠中学、马莲渠中学、杨马湖中学、黄沙窝学校、扁担沟学校560分以上的考生即可录取到吴忠中学。吴忠中学初中部在吴忠中学录取中享受相应的倾斜照顾政策。
自1994年实行会考制度10年来，会考课程共90门次，学校平均分、优秀率有84门次课程进入自治区前10名，占会考总课程的93.3%；63门次课程进入自治区前5名，点会考总课程的70%；20门次课程取得了自治区第一的好成绩，点会考课程的22.2%。在2005年会考的9门次文化科目考试中，我校有4门学科（语文、英语、物理、化学）平均分居自治区前10名，有6门学科（语文、英语、数学、06届07届物理、化学）优秀率居全区前10名。自治区会考办的领导经常说：“吴忠中学是全区会考的一面旗帜。” 2015年，吴忠中学会考再创佳绩。
自1998年以来，学校先后共获得各级各类奖励81项，其中国家级奖励6项，自治区级奖励33项，地市级奖励35项，县市级奖励7项；这在全区各重点中学中是首屈一指的。截至2013年，学校的教育教学质量、科研质量以及信息技术教育设施建设一直处于自治区领先水平，吴忠市第一。
2009年高考成绩揭晓，市区二本以上上线人数687人，上线率27.7%（全区平均23.7%），其中吴忠中学有221人上重点分数线，有555人在二本分数线以上。该校王燕同学以644分全区第14名的成绩成为宁夏考取清华14名学生中的一员。根据往年的高考录取情况，吴忠中学加上随后民族预科生的录取，二本考上人数将过700人，再加上专科和高职录取的学生，预计今年吴忠中学将有1000人上大学。
