红曲的工艺，主要掌握五个环节：
一、生产红曲：必须选用优质大米。一般大米必须经过再一次的碾白工序排除米糠、碎米及、谷皮、杂质，直到纯度100%，选好料后，把它放进水池流水浸泡24—36小时，水比大米高出30厘米，使它吸收水分。然后取出，置于蒸床内蒸熟，时间掌握5—10分钟，气压4.5公斤的1吨锅炉，温度150℃，蒸后倒出成堆。然后再进行第二次复蒸（时间约为5—10分钟），使大米蒸至透心时取出，铺摊于竹箩上，冷却至20℃上下备用。
二、配方拌料：经过蒸熟冷却后的大米，拌同醋糟辅料配制红曲霉培养基。其配方有二种：
（1）大米100斤，老醋3斤（要求3年以上的陈醋）土曲糟5斤。
（2）大米100斤，红曲7斤，米饭5斤，老醋5斤。
配方一把老醋、土曲糟拌进蒸熟的大米搅拌均匀，达到米饭通红为止。配方二则先把红曲磨成粉末，米饭煮至如稀饭一样稠粘后，把初曲及醋拌进，然后调到蒸熟的大米中去，反复搅拌直至通红。如用搅拌机，每小时可拌4千斤。
三、室内发酵：
红曲主要依靠红曲霉菌的繁殖与生长，它所适宜的温度为40—45℃。发酵室必须洁净无味，室内宜用粘土与砂质土壤合成的地面。这种地面容易干燥，每隔一年半后还要进行一次更新，以利交赤散于室内地坪。打开通风窗15分钟后第二次发酵时，再把它集中成山形，加麻袋覆盖，密封6小时，堆温以35℃为宜。然后又铺散于地面，室温不宜低于20℃，保持闵12小时后，开窗通风，并翻动一次，使其均匀。再经12小时后又进行一次翻动，继之每隔8小时翻动一次，目的是使底、面均匀。若室温不足可用电热或炭火加温。 夏天气温高时注意通风或以其他设备降温。
各个曲种的发酵期有所不同。若是制库曲，在室内应发酵9天，每10斤大米可制成4.5—5斤重量的红曲；若是制色曲，室内要多发酵5天，使红曲霉蔓延至内部，以内外呈通红无斑点为度，每10斤大米，只能制出2.5—3斤曲量；若是制轻曲，只要多发酵2天，室温保持40℃使全部米心发酵通红，每10斤大米制3—4斤曲量。
四、加温发酵：
为使红霉菌加快繁殖，红曲在发酵过程需要加温，促进发酵。因此，在发酵4天后，用麻袋将曲种装好，放入水池，使其吸足水分后提起（约20分钟），再回到发酵室内堆成山形，密封2天，室内温度不得低于30℃。然后摊开铺散于地面，打开通风窗，并喷洒清水。每100斤大米，喷清水40—50斤，用喷壶喷洒均匀。以后每隔一天翻动一次，使上下温差平衡，发酵均匀，直到出房为止。
五、出房曝晒：
红曲从大米至发酵结束，全流程只需9—14天时间，发酵好的红曲及时提出铺于竹席上，置于列日下曝晒。晒曲时间，春、秋、冬各12小时，夏天7小时，晒曲时要翻动5次，使其干度均匀。若红曲出房期正逢阴雨天，必须把红曲摊铺于通风地板上晾干。
红曲成品表面红中含青，用手指捻，可成红粉末，色泽艳丽。成品用袋包装后，应置于密封仓内保管，防止受潮。若贮藏时间过长，发现生虫，必须及时翻晒，用烈日强光驱杀，切不可用药物毒杀。
红曲米酒的功效与作用
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红曲被称为“中药他汀”。
红曲为曲霉科真菌紫色红曲霉寄生在粳米上而成的红曲米，历代又称之为赤曲、红米，福曲等。《本草纲目》中有“红曲主治消食活血，健脾燥胃。治赤白痢，下水谷，治打扑伤损，治女人血气痛及产后恶血不尽”的记载。《神农本草经疏》记载：“红曲消食，健脾胃，与神曲相同，而活血和伤，惟红曲为能，故治血痢尤为要药。” 历代医家均认为其具有健脾和胃、消积止痢、活血化瘀功效。红曲作为药食两用的中药历史悠久。
然而，红曲在国际上真正引起重视还要追溯到上世纪70年代，日本远藤章教授从红曲发酵液中发现并分离得到能显著抑制体内胆固醇合成的活性物质莫纳克林K，全世界的科学家开始对天然红曲及莫纳克林类化合物给予了新的广泛关注。经研究发现，红曲有多种次生代谢物: 莫纳克林系列( K，J，L，M，X) 、γ-氨基丁酸、甾醇、氨基葡萄糖、皂苷、红曲色素、真菌毒素桔霉素、葡萄糖淀粉酶等酶类成分。其中莫纳克林 K与降低血脂关系尤为密切，相当于一种天然的洛伐他汀。目前大量的实验室以及临床疗效观察证明了无论是红曲单药制剂还是红曲复方制剂都可以明显改善高脂血症症状，降低 TC、TG、LDL-C，升高 HDL-C。
现代医学中的“血脂”与中医学中的“膏”、“脂”类似，而血脂异常多是由于饮食不节、脾失健运、痰浊不化、瘀血阻滞、肾气衰弱、肝胆失于疏泄引起，“痰浊”和“血瘀”是血脂异常最常见的临床辨证分型。红曲性温味甘，有健脾化痰、活血化瘀的功能，故可降痰浊、行气血，改善患者的体质，治疗高脂血症。因此，红曲被称为“中药他汀”，给他汀不耐受的高脂血症患者带来了福音。
红曲的食用方法：1、煮粥直接食用，可与大米或小米一起煮。2、酿酒：酿出的酒类似黄酒的味道，可以少酌。3、做菜：红米粉是天然着色剂，不但无害，而且具有很高营养价值。可以用来制作红烧肉、红鸡蛋等。做糕点时，也可以加入少量红米粉，以增加营养和色度。4、卤制品：做鸭脖、鸭翅、鸡翅、豆干等的时候，加入红米粉，不但颜色亮丽，而且增加了营养成分。
