开始时主角从家里出来，在村子里逛了一圈后，就往上走，想出村玩玩。结果被大木博士叫住，他告诉主角村外的草丛里有许多野生的精灵，不要贸然出去，而且把主角叫到了他的研究所。选精灵吧！对手在你选好之后选了一个克制你的精灵。正准备出研究所，却被对手叫住，开始了第一次的战斗，艰难战胜后往上走出村。路上有人送主角伤药。之后来到了第一个城市：常磐市。到了SHOP里后售货员给了你一个包裹，回去交给博士，博士送了你和对手怪兽图鉴，这时，真正的冒险才刚刚开始。离开研究所后到上方的对手家里向他姐姐索取旅行必备的地图（如果此时不索取，以后就拿不到了）。
通过常磐市之后一路向北，进入了常青森林，里面有许多的训练家，一一找他们单挑吧！这个森林有点复杂，但只有一条路可以出去，所以轻松出了森林。到了日比市后，右边的通道有人把守，无法通过。可以先去博物馆看看，增长一下见识。来到小刚的岩石系道馆挑战，战胜后可得到灰色徽章。这时回到常磐市左边又能遇到对手，他变强了哦！再从日比市从右边走。还有人送你跑步技能。（按B就能跑了，速度快很多，爽）接着来到月见山。山洞旁边的PC里可以花500円买到一条鲤鱼王。山洞内遇到了火箭队的一些小喽喽的抵抗，还碰到一个考古学家，战胜他后在两块化石中选一块（左边化石盔，右边菊石兽）。好不容易出了山洞来到花田市。这里有一家自行车店，里面的自行车太贵，买不起。来到水系道馆挑战小霞，战胜后得到蓝色徽章。之后北上，又遇见对手，艰难战胜后他送你人物图鉴。继续北上，挑掉众多的小喽喽后来到东北角一间屋子。进去后和皮皮对话，再启动电脑，正木博士走了出来，一阵闲谈后送主角一张船票（重要道具，以后会用到）。回到花田市，警察已经让路了，进入房间，发现里面一片狼籍，从墙上的洞里进去，发现一个火箭队员，打败后得到挖洞技能。由于右边的道路被一棵大树挡着，所以只能往下面走。途中路经一个饲养屋，里面有人专门帮你饲养精灵。由于下面的房间里有人阻拦，所以只能走地道。一阵狂奔后来到枯叶市。由于去道馆的路也被一棵树挡着，所以先去了左上角的一间屋子。和里面的人一番长篇大论后，得到一张兑换卷（可以拿到花田市的自行车店里兑换一辆自行车^_^）。在PC屋左边的小屋里还可以得到一根初级鱼杆。来到码头，向水手出示船票后，进入船内。挑战世界各地的训练家，还能在厨房的垃圾桶内找到三颗果实（现在不拿，以后就拿不到了）。我正想往顶楼走，却又遇到了对手，战胜后来到船长室。船长身体不适，帮他按摩后他好了，为表谢意他送我特技01居合斩。然后就能挑战道馆了。战胜马志士后得到橘色徽章。
出了码头往右走，发现一个山洞（地鼠之穴）。通过后往下走，来到一间小屋，和一个人对话，如果你拥有的精灵数超过了10种，就可以得到05号特技闪光。去日比市的博物馆用砍树从后门进入，可以得到一块琥珀。这时去花田市右边的道路，打败一群训练家后来到一个山洞前，此时最好去旁边的PC恢复体力。进入山洞后使用闪光特技，就能使视野变亮。一番折腾后出了山洞，往下来到紫苑市。这里有一座为纪念死去的精灵而建造的幽灵塔。沿楼梯而上，发现里面有许多人，使用的都是幽灵系精灵。还有野生精灵居然也是幽灵，无法看清真面目，不能对战。眼看就要到顶楼了，一个奇怪的精灵突然出现，拦住了我的去路。没办法，只好下楼。与居民谈话得知，要使那只精灵现出原形，需要幽灵眼镜。先往城市下方走，一只卡比兽正在睡觉，挡住了去路。回紫苑市，往左经过一个地下通道，来到了玉虫市。这里有一个百货大楼和一个百货商店，还有游戏厅。去百货大楼里可以问一个老奶奶得到茶（重要道具，一定要得到），从后门走到顶楼还可以得到一只依布。到百货商店的5楼后从楼梯上到顶楼，分别购买三种饮料给小女孩，可以换得三种技能。然后去挑战GYM吧！这次的道馆是草系道馆，应该很轻松吧！战胜后得到彩虹徽章。在一间屋子内和一个人对话得到了硬币盒，接着就能去游戏厅玩游戏了。在一幅画前看见一个可疑人物，动不动就打起来，战胜他后他消失了。我对着画研究了一番（按A键），右边突然出现了一条楼梯，不入虎穴，焉得虎子，进去看看再说。在地下4层得到电梯钥匙后，坐电梯再次来到地下4层，找到了火箭队老大：阪木。将其击败后得到幽灵眼镜，可以让幽灵塔中的那只精灵现出原形。回到幽灵塔，那只神秘的精灵终于现出了真面目，原来是一只嘎拉嘎拉。让它的灵魂升天（将其击败）后往上走，救出富士老人。作为谢礼，他送了我精灵魔笛。这下就可以去收服两只睡在道路中间的卡比兽了。来到卡比兽旁边，使用精灵魔笛，它醒了，收服它吧！在玉虫市的卡比兽被收服后，砍树去旁边的屋子，可以得到特技02飞空术，这下就能自由地在所去过的城市之间飞行了。经过一段下坡之后来到石竹市。这里的毒系道馆有隐形的墙，需要穿过才能到达馆主所在的地方。击败他后得到爱心徽章。在PC屋旁边的房子里（右边一幢）能拿到中级钓竿，左边一幢里的一个老爷爷说他的假牙掉了，让我帮他找找，我很爽快地答应了。进入上方的精灵原野区，这里有很多的精灵任你捕捉。走到一个地方终于找到了假牙。然后继续深入，在600步之内走到了最深处的一间屋子，问里面的人得到了特技03冲浪术，这下就能自由地走水路了。出原野区，把假牙还给老爷爷，老爷爷为了答谢我，送了我特技04怪力术。突然想起地图中间的城市还没去过，于是飞到最近的城市玉虫市，从右边的通道过去。门卫说口渴了，我就把老奶奶送的茶给他喝，他就放行了。进入山吹市，发现都是火箭队的人，于是来到山吹大厦，发现这里已被他们占领。我立刻闯了进去。在9楼的一个护士会帮你恢复体力，这样就省去了回PC的时间。在5楼下方找到了开门用的万能钥匙后去3楼。将一扇门打开后走一个传送点到7楼，发现对手也在。击败他后和旁边一个人说话，他送了一只乘龙给我。最后通过一个传送点来到顶楼，再次击败阪木，救出公司社长。为表谢意，他送了我一个大师球（全游戏流程只能得到一个，可以抓住任何精灵，须慎用）。接着去打道馆，发现有两个道馆？！进入左边那个道馆内，一路获胜后打败馆主，他要送我一只精灵，盛情难劝，只好收下。这里有两只精灵，二选一（左沙瓦郎，右艾比郎）。接着来到右边的道馆，发现有很多传送装置。必须从到达地的反方向走（如：传送到了左下角，接着就该往左上角走）。战胜馆主之后得到圆月徽章。这时去10号公路的黑暗山洞入口处，往上走，经过一段水路来到一座无人发电厂。最深处发现一只雷电鸟。机不可失，时不再来，快点Get它吧！若打死它或逃跑它也会消失的，用即时存档搞定。然后回到石竹市，往下经过一段水路来到双子岛。进入双子岛后，得推几块石头到水里堵住水流才能前行。最深处遇到了急冻鸟，Get吧！回到自己的家，往下方冲浪一段路后来到绿岛。岛上有研究所可以将先前得到的化石和琥珀还原成精灵。去打道馆，却发现门锁住了。之后得知钥匙在左边的废弃大楼里。里面有一系列机关要控制开关，最深处终于得到钥匙。战胜火系道馆馆主后得到火焰徽章。出了道馆后被一个人拉着坐快艇来到了一个陌生的地方（橘子群岛）。
出了码头，我到了1号小岛的大型PC屋里，却被告知电力设备出了问题，不能使用电脑，也不能通信，需要两块宝石才能修复，但不知宝石在哪里。于是我就在这个岛上随便逛逛，到了岛屿的北部，发现一个山洞。里面有温泉，走到温泉的中心可以让精灵恢复体力。与旁边一个老大爷对话还能得到特技06碎石。继续向北，发现一座山。好奇心驱使着我继续前进。在山顶终于遇到了传说中的精灵火焰鸟，经过一番大战，终于收服了它。之后回到码头，现在可以去2号岛屿了。一路狂飙来到2号岛，在岛上的游戏中心里有人告诉我他的女儿去3号小岛采集果实，至今未归，他很担心。助人乃快乐之本，我答应帮他寻找小女孩。在小岛北部有一间小屋，如果把一开始选的主兽（妙娃种子、小火龙和杰尼龟）放在首位，那么里面的人会教给它们新的3招必杀技（暴烈燃烧、水柱加农炮和硬化植物，威力150，命中90，攻击完后一会合不能动）。继续去坐快艇狂飙到3号岛。一上岛就发现一伙飞车党在瞎逛。来到村庄后发现飞车党与村民起了争执，于是我上去劝解。没想到飞车党居然把矛头指向我，来者不惧，我将他们一一打败，他们只好遗憾地离开村庄。一路左行进入树果森林。到了最深处终于找到了小女孩，但他她却一动不动。这时突然跳出一只素利柏，原来是它在用超能力捣鬼，我一下解决了它，之后小女孩得救，与她父亲说话会有奖励的（如果不说话是无法发展剧情的）。我也回到了1号小岛，被一个人送回了绿岛。现在只差常磐市的道馆没有去过了，飞到常磐市，发现道馆的门已经打开。馆主不是别人，正是火箭队老大阪木！他的实力这时已经强了很多，要小心应对。战胜他后得到绿色徽章。然后与他说话，他消失了，在原位可以找到装备在精灵身上努力值加倍的道具。我现在已有了8枚徽章，可以去挑战精灵联盟了。途中再次遇到对手，正好试试自己的实力。经过了一路的徽章检查，我进入冠军之路。这里需要将石头推到白色的装置上打通道路。经过一路颠簸，终于来到了目的地——精灵联盟。在PC屋恢复体力并购买了必要的道具之后，我进入小精灵联盟，向四大天王发起了最后挑战。在艰难战胜了四大天王之后，却被告知对手已经先我一步战胜了四大天王，如果我想成为新一任的口袋霸者，必须再战胜对手。事已至此，只能硬着头皮上了，经过最后的决战，我终于成为了新一任的口袋霸者。大木博士得知我成为了新一任的口袋霸者，带我进入了口袋殿堂，只有强者才能进- - 很辛苦，加分吧
冒险，从莎拉镇开始了。不论是奥得博士的研究所还是小键的家，都座落于这个城镇中。前往至第1线路之后，奥得博士就会登场，乖乖的和他去研究所吧！桌子上有三个精灵球（妙蛙种子、杰尼龟和小火龙）去选择一个自己喜欢的怪兽（本人选择小火龙），博士拜托你去道吉市的友谊商店拿回托送物品，刚要离开，小键前来挑战，于是，你的初次对决开始了（战斗过程中系统会有战斗提示，所以初学者不用担心）轻松获胜后，去道吉市友谊商店从店主那里得到托送物品，回来交给博士，就会得到口袋怪兽图鉴了，要离开家乡的时候，千万不要忘记去姐姐家里索取地图（城内地图）那可是冒险必备之物。 通过了1号道路后，再次来到了道吉市，如果此时前往左边的22号道路，就会再次与小键战斗（依据此处战斗的胜负结果，小键所拥有的怪兽进化形态也会发生变化），在游戏的开始阶段道吉市立体育馆是无法进入的，所以只好向北方进发了（出口处的老爷爷会教你如何进行怪兽捕捉，初学者好好学习一下吧！）通过了2号道路的道吉之森出入站后就来到了神秘的道吉之森，这里有不少怪兽训练员，可以和他们进行挑战以获取经验值和金钱,这里的路上可以拣到广播电视，可以随时提供在线演示，十分方便。森林里生活着各种各样的昆虫系怪兽，如果这时有飞行系的怪兽在队伍中，会对战斗十分有利！ 走出森林后，来到了比尼市，如果认为怪兽等级够高的话，就去挑战比尼市立体育馆的小刚吧，看过动画的人应该知道，他可是训练岩石系怪兽的高手。打败他以后获得了灰色徽章和39号秘籍（岩石封印 100％追加效果让敌人速度下降一个等级）比尼市最著名的科学博物馆是向游人开放的，只要花50元就可以进入参观，里边可以看到传说中的口袋妖怪化石镰刀盔和化石翼龙的骨骼标本，二楼还可以看到航天飞机的模型，有一对亲子虽然很想要主角身上的怪兽，但是因为和所有人很熟识地缘故，所以只好放弃了。 离开了比尼市，来到了3号道路，这里到奥西米山洞之间有八位训练员登场，好好利用奥西米山洞入口附近的pc进行及时的恢复吧，在pc大厅左上角会有人出价500元卖秘密怪兽,其实就是鲤鱼王，玩过红绿蓝的朋友应该不会上他的当了吧。 一切准备就绪以后，就可以进入奥西米山洞了，里边同样有很多训练员等候主角的挑战，而且，还有身穿黑色衣服的火箭团挡路，经过了重重难关终于到达了山洞的另一端，这时会和考古专家对战，战胜后取得化石的其中一种（左边龟壳化石，右边甲壳化石）不管是做什么用的，先出洞再说（怪兽快撑不住了啊） 来到空旷的4号道路，途中会遇到两个格斗家，可以向他们学习威力强大的招式，左边的会教授冲钳，右边的会教授花踢（好怀旧的招式啊！）一定要记得让你的怪兽学习，之后来到了著名的水都（守护神?）——那达市，在那达市中，拥有水系怪兽的馆主小霞早已经做好准备在此等候着主角的到来，将其击败后可以取得蓝色徽章和03号秘籍（水波动有20％可能性追加效果让对手进入混乱状态），在pc左边的屋子里，老人会向你交换红唇姐（就是冰系＋超能力系的那个人形怪兽)，但是你要有蚊香蛙才可以换得，左上方民居内的老人会给你解释各属性的特点，现在如果没有兑换卷的话，自行车价格简直是天文数字（1000000元）所以不要理会，向北方继续前进。 刚到24号道路，小键再度出现，他的怪兽非常厉害，属性也很全面，要用相克的属性招数来对付，战胜后他会送给主角类似于前作口袋导航仪的装置，主要用于和重要人物、馆主进行联络。在离开了那达市后，来到了黄金球大桥，只要打败桥上的五名挑战者并击败火箭团员（刚开始说话还挺客气，后来狐狸尾巴就露出来了）就可以获得金珠最为奖励，进入25号道路后仍然有许多挑战者严阵以待，注意善用恢复道具，继续向前走会看到一个小屋，屋里面只有一只皮皮，和他对话后发现原来是个人，等他进入交换机以后操作下边的电脑就可以帮助他恢复原状，为了表达谢意，他会送给你非常重要的安尼号轮船的船票。再度回到那达市，右边房子门前的警卫会让开，进入后发现屋内一片狼藉，顺着脚印从后边的洞口出去，会遇到火箭团的人（真是无恶不作，让人家怎么住啊？）好好教训他一顿以后，他留下了28号秘籍（挖洞蓄力一回合第二回合攻击，可用于逃出迷宫）逃之夭夭。继续向下方前进，就来到了5号道路，顺着坡道下来可以进入精灵屋，可以在这里存放你的怪兽进行养育，下边的山野市检查站有检查人员暂时无法通过，所以，只好走右边的地下通道了，入口处的小女孩可以用尼多娜换取尼多兰。 通过了地下通路，来到了6号道路，这个地区有两对男女组合，要小心应付。一直向下就来到了库吉市，在pc大厅的柜台前有人会送你远程呼叫器，这个东西可以让你反复挑战已经挑战过的训练员， 只要在此人附近使用就可以进行“挑衅”但是，每呼叫一次都要蓄电，所以，还算是有用的东西。在口袋人气俱乐部内，如能忍受会长的长篇大论，就可以从他那里拿到自行车兑换卷（还记得上边提到的天价自行车吗？现在可以免费获得了！）在海边的小屋里和钓鱼人谈话可以获得初级吊杆。由于，库吉市修行场前边的道路被小树阻挡无法通过，所以，还是先上船再说吧！向水手出示了船票之后就可以进入安尼号了。 在船舱的客房里又很多游客会与主角对决，所以，恢复自然是少不了的，一进门右数第二个房间里，和女孩说话就可以进行恢复了。在底层餐厅的垃圾桶里可以找到放树果的袋子，以后可以通个这个道具存储各种果实。来到二层船长室门前和小键进行第四次战斗后，进入船长室和船长说话就可以得到01号秘传技（间合斩普通攻击技巧，可以破坏小树和草地），刚离开了安尼号，船就离去了。 让队伍里的怪兽学习间合斩以后，破坏库吉市修行场前边的小树后，就可以进入挑战了，馆主是电系怪兽的使用者马奇士，这里要注意一下，修行场内的机关比较麻烦，建议4号秘籍（电击波必定命中对手）继续向右前进，经过11号道路，来到12号道路入口的2楼，奥德博士的助手在此等待主角的到来，只要现在捕捉怪兽数量在30只以上，就可以和他换取透视仪，相信大家对这个仪器都不陌生了，它可以寻找地图上的隐藏物品，上方的男孩会那尼多利换取尼多利娜，刚要准备向12号道路前进，一只硕大的石翼龙兽就挡在了路的中央，阻止了前进的道路，没办法，只好原路返回。 来到11号道路，这里会看到地鼠洞穴，从这里可以回到以前经过的2号路，途中的房间找玩gba的男孩可以用凯西换取吸盘魔偶，以前被小树阻挡而无法通过的地方现在也可以通过了，下边的房子里可以拿到05号秘传技（闪光使对手命中率下降一个等级，可以扩大黑暗中的视野范围）条件是必须要捕捉到10种不同的怪兽，一定要记得拿啊！ 下一个目标就是曾经去过的那达市了，途中会经过比尼市，科学博物馆右侧的树现在可以破坏了，从这里可以进入到博物馆的后门，和中间的学者说话后，得到秘密的琥珀（请大家记住这个物品，以后要用到的）右下角的工作人员会教授格斗系代表招式地球掷（伤害值和等级相同）几经周折，又回到了那达市，这回有了间合斩的帮助右边的通路也没有问题了（玩这个游戏记忆力不好可不行）把挡路的小树砍掉后来到9号道路，经历了众多训练员的战斗后，来到了依亚隧道旁的pc进行恢复，pc中心大厅右边的白衣人会给你不变之石，条件是要捕捉20种不同的怪兽,恢复完毕后进入依亚隧道！ 隧道内漆黑一片，只有有限的一点可视范围，幸好之前拿到了05号秘传技闪光术洞穴里的结构比奥西米山洞略显复杂，主要是围绕两层转，训练员以怪兽小子和登山者为主离开依亚隧道后经过10号道路来到了著名的鬼市——西奥镇。 西奥镇给人一种非常神秘感觉，座落于城市东方的精灵塔更是云雾缭绕。由于城市并不宽阔，所以，当中也没有设立道馆，这些大概都应该要怪罪于为了慰藉口袋妖怪灵魂而兴建的口袋妖怪精灵塔了吧？虽然总觉得散发着些许令人害怕的妖气，但是，还是阻止不了我们的调查行动。位于城中的是怪兽之家，听家里人讲，身为怪兽之家长老的富士老人，自从精灵塔之后就行踪不明了，南方的小屋是姓名占卜师家，可以给你的怪兽更改姓名。为了解救老人，我闯入了精灵塔，塔内的训练员全部是巫女，使用的是幽灵系怪兽，建议大家用恶系的招式对付，遇到的敌人都是呈雾状的，所以无法进行实体攻击，只有逃跑。（第五层有一个结界可以进行恢复，中央取得灵符）当我即将到达最高层时，在楼梯前遇到一个30级的雾状怪兽,由于无法进攻也无法前进的缘故，我只好离开了精灵塔去寻找破敌的其他方法……从镇上人那里得知，要让黑雾现身只有去达西市取得西罗夫奇，所以，只有先离开这里了。 从左边出城经过第8号道路，由于通往山野市的入口有警卫看守，所以暂时从上边的地下通路走吧。出了通路经过第7号道路来到了最繁华的达西市，首先利用间合斩到达达西市立体育馆，馆主是喜爱花草的草系怪兽训练员艾利卡，战胜后获得绿色徽章和19号秘籍（电击流命中后将伤害值的一半进行恢复）现在要去百货顶楼购入一些饮料（送礼用）给旁边的小女孩可以得到回报，送她美味之水可以得到16号秘籍精神汽水可以得到20号秘籍米力液可以得到33号秘籍。另外，从右边大楼后门进入的话，在顶层的房间桌子上可以拿到伊布。关于本市的游戏大厅的游戏介绍，我就不再做文章了（请各位会员期待以后的详解吧！）大厅右边壁画前有个火箭团员形迹可疑，和他说话居然大打出手，将其击败后调查壁画，发现右边出现楼梯，这里应该就是火箭团的地下指挥部了。 火箭团的地下指挥部一共分为四个场景，有两个场景都会出现传送带机关，要先看好传送路径以后在去踩，千万不要太心急，因为这样会更加麻烦的。既然是火箭团的基地，训练员肯定是一水的团员了，轻松的来到B4F,击败左上方房间内的团员以后，他会交给你电梯钥匙，进入电梯（每层的右下方红门）使用电梯要是以后就可以进行楼层选择了，来到B4F，门口有两个团员要一一击败门才会开放，里边坐在沙发上的就是火箭团的魔王——萨克奇，他的怪兽是大岩蛇铁甲犀牛和袋熊，击败他以后可以拿到西罗夫奇（还记得这个东西吗？它就是可以破除精灵塔内黑雾的关键道具）现在可以顺原路返回西奥镇了。 再度进入神秘的精灵塔，由于有了西罗夫奇的帮助，这下就可以看清黑雾的真正身份了，原来是一只30级的哥拉（它是无法进行捕捉的）击败它以后进入塔顶，原来富士老人是被火箭团绑架的，连续击败3个团员后解救老人，作为回报富士老人会把自己珍藏的口袋妖怪之笛送给主角，他可以唤醒沉睡的石翼龙兽，这下又有很多未知地带可以到达了。 由于游戏里一共有两只石翼龙兽阻挡的道路，所以，下面我将分别写出两条线路的攻 线路1：从西奥镇左边通过第8号道路的地下通路来到达西市左边的16号道路处唤醒石翼龙兽（这种罕见的怪兽一定要捉啊！）通过间合斩砍断小树以后到达左边的民家，和小女孩对话可以得到02号秘传技（飞空术第一回合消失第二回合攻击，可以到达以前去过得城市）快让你的飞行系学习吧，这个可是非常方便的技能！在通过自行车道入口大楼时别忘了和二楼的博士助手对话，如果此时你的怪兽种类已经到达40种以上时，他会送给你守卫饭（和训练家战斗后金钱获得2倍，就是红蓝宝石版通关后妈妈送的东西啦！）出大楼以后来到自行车专用下坡道17和18号道路，如果之前没有取得自行车的话，是无法进入的。顺利滑行至沙吉市入口大楼（左侧），二楼的黄发男孩会用大舌头换取哥达鸭，出大楼进入沙吉市。 线路2：利用飞空术回到库吉市，通过右边的11号道路入口大楼（如果之前没有得到透视仪的现在可以到二楼取得，不要告诉我现在还没有捕捉到30种怪兽）出大楼来到12号道路，同样方法击败（捕捉）挡路的石翼龙兽，第12号道路是垂钓者的聚集之处，水系训练员很多。向北方走又可以回到西奥镇，向南方前进会看见一间小屋和屋内渔夫的儿子说话可以得到中级钓杆，继续向下走会来到13号道路，这里地形较为复杂，由众多栅栏组成，由于下面还要经过训练员区，所以建议做好恢复准备以后再向下前进，经过了13 、14和15号道路的漫长旅途之后，终于到达了沙吉市入口大楼（右侧）二楼同样可以找到博士的助手取得学习装置（就是队伍中的怪兽不战斗一样可以分配到经验值和努力值的东西）要求是要收集50种不同的怪兽，出大楼进入沙吉市。 进入沙吉市后，首先要去沙吉市立体育馆和使用毒系怪兽的馆主强进行对决，体育馆内有很多隐形的墙壁，只要多走走就可以到达馆主所在的位置了，击败强以后可以获得爱心徽章和06号秘籍（猛毒使对手进入中毒状态，毒伤害随回合数增加而提升）找pc左边的屋子里的人，可以让你的怪兽忘记之前所学的一种招数（对于秘传技招式无法覆盖的，现在可以直接消除了）右边的第二个屋子可以得到高级钓杆，第一个屋子的园长会要你帮助他找丢失在沙狐区的金色假牙。为了可以得到奖励，只有向位于北方沙狐区前进了， 花费500元可以得到30个沙狐球，而且有步数限制（600步），难度也是很大的，在区域3的训练所中可以得到03号秘传技（冲浪术攻击技巧，可以在水上移动）学会以后从下边的水池游过去，就能在草丛中找到金色假牙了，回去交给老人可以得到04号秘传技（怪力攻击技巧，可以推动怪石)右边刚才不能推动的石头现在可以了，取得奇异甜食 通往山野市的入口（四个）都有警员把守，从他们的说话态度来分析，这几位警员大概都非常渴，所以先飞回达西市，到百货大楼右边的高层建筑第一层找老奶奶要好喝的饮料（千万不要买百货大楼顶层自动贩卖机里的饮料，那三种他们不喝的），把饮料交给其中一个入口的警员之后四个入口都可以通行了，进入山野市，城内看来已经被火箭团占领了，山野市立体育馆的门有团员把守暂时无法通过，先去挑战左边的格斗道场吧！击败老师之后，就能够获得格斗系怪兽代表艾比郎或沙瓦郎。下一个目标就是位于市中心的西罗夫公司总部，这座大楼一共有11层，内部很多地方由传送点构成，首先在第5层下方拿到钥匙卡，现在可以打开一切封闭的门了，9楼左下有个房间的女孩可以进行怪兽恢复，从3楼中央的传送点可以传送到7楼左上的封闭房间，小键在这里等候着主角的到来，战胜他之后从下边的传送点来到最高层，这里要挑战的是企图侵占西罗夫公司的萨卡奇，战胜他之后可以从会长那里获得大师球！山野市再度恢复了平静。体育馆没有了守卫，这下就可以挑战超能力系怪兽的训练者娜紫美了，体育馆内全部是由传送点构成的，相信有了刚才的经利，这点困难也不算什么了吧，战胜后获得圆月徽章和04号秘籍（冥想自身的特攻特防值上升一个等级） 离开山野市，用以前学会的冲浪术进入市南的19 20号水路，途中登陆孤岛——双子岛，洞内结构非常复杂，冰系怪兽较多遇敌几率很高，等级不够的还是不要擅自闯入了，到达一出全是岩石的地方，用怪力将其中两块顺着洞推下去，然后跳下，原来了激流也被堵住了，往前游一段，就可以看到三圣兽之一的急冻鸟（lv50）捕捉！出了双子岛山洞，由于前方水路不通，所以只好用飞空术回到主角的家乡沙拉镇了。回家恢复一下后，向南方的21号水路前进，和众多水系训练员一一战斗之后来到了南方的小岛——库林岛，这里的口袋妖怪研究所可以帮助你复原之前拿到的化石（一个是奥西米山洞二选一的化石，一个是比尼博物馆取得的神秘的琥珀）交给第三个房间的研究人员吧。去调查库林岛修行场的时候发现门是锁住的，所以只好先去口袋妖怪小屋里一探究竟。在第一层调查一个超梦的石像，启动开关后右边的铁门会交互的开放，在三楼的一个桌子上发现关于口袋妖怪超梦与梦幻的报告，最后到达地下一楼取得桌子上的秘密钥匙和下方的草系太阳光线秘籍以后，到库林岛修行场用钥匙开门后就可以挑战火系怪兽的使用者卡兹拉了，修行场内又很多关闭的门，要通过启动旁边的机器才可以打开，战胜卡兹拉以后可以得到火焰徽章和38号秘籍（大文字有10％的可能性追加烧伤效果）刚出修行场大门，就被人强制送到了陌生的第二块版图1号岛屿。 岛屿上方的山洞内可以泡温泉来恢复怪兽的体力，找洞内的白胡子老人说话可以得到06号秘传技（碎岩攻击技巧，有50％的可能性追加效果让敌人的防御力下降一个等级，可以击碎岩石），由于电力问题所以此处的pc都无法存取怪兽,只有先去位于1号岛屿北部的孤岛一探究竟了，经过了火焰捷径来到了孤岛的山顶，三圣兽之一的火焰鸟（lv50）正在这里等候，捕捉！回到1号岛屿坐水世界号来到2号岛屿，进入一民居得知主人家的小孩去3号岛采集果实至今不知下落所以请求主角的帮助，之后发生电单车党闯入事件，北方小屋里地巫女会教授怪兽水系代表招式高压水枪。坐船来到3号岛屿，刚一上岛就发现单车党和岛屿居民发生了冲突，上前帮助居民，分别打败三个人之后，头目出现（使用的怪兽为双弹瓦斯和臭臭泥）击败后敌人撤退（此时电力全部恢复）。继续往岛屿左方探索，进入果实森林，利用间合斩和冲浪术来到森林最深处，找到失踪的小女孩，但是发现她根本无法行动，正在奇怪之时，突然从树丛中跳出一直索利普，将其收服以后，小女孩得救，回到1号岛屿的大型pc中心领赏（具体是什么，冷某实在没有看清，请知道的朋友告知）并且送回了库林岛。 还差最后一枚徽章了，还记得道吉市那个关闭的体育馆吗？现在应该开放了，用飞空术直接飞至道吉市，进入道吉市修行场这里的馆主就是之前那个无恶不作的火箭员团长萨卡奇，他使用的怪兽属于地面和毒系，战胜他以后可以得到羽毛徽章和26号秘籍（地震攻击招式，对手使用挖洞时攻击力加倍）至此，全部的八枚徽章入手，但这并不表示此游戏的终结，更加厉害的对手还在等待着主角的挑战！从道吉市左边的出口进入22号道路，再度遇到小键，他的怪兽果然有很大的长进，尤其是主题怪兽，顺利的战胜他之后对手离去。 最关键的时刻即将到来，我来到了冠军道路，这里设立了八个检查站，只有获得全部徽章的人才可以顺利通过，进入洞穴，这里的训练员果然全部都是超强，一定要注意保存体力和bb值,这里要用怪力把石头推倒白色机关上边才可以消除阻挡的墙壁，在三楼的一处把石头推下洞穴，再跳下来用这块石头压住左边的机关，就可以到达洞口了，出去以后会看到由乱石组成的道路，只能走右边的那条路才可以到达石英高原的主楼，进入大厅后，选取自己最厉害的队伍进入挑战游戏的最终关卡——四大天王和冠军。 四大天王与冠军阵容： ` KANSU:lv52 白海豹 lv51 铁甲贝 lv52 胖顿 lv54 红唇姐 lv54 乘龙 SIPA:lv51 大岩蛇 lv53 艾比郎 lv53 沙瓦郎 lv56 豪力 lv54 大岩蛇 ? 菊子:lv53(这个等级没有看清楚)耿鬼 lv54 大嘴蝠 lv56 阿柏怪 lv58 耿鬼 lv53 鬼斯通 WATORU:lv56 暴鲤龙 lv54 哈克龙 lv54 哈克龙 lv60 快龙 lv58 化石翼龙 小键:lv59 比雕 lv63 主题怪兽（根据你所选的主兽） lv59 铁甲犀牛 lv57 胡迪 lv59 暴鲤龙 lv61 风速狗 将下来你要达到一些条件才能去彩虹诸岛的4、5、6、7号岛，首先你要
1、已经捕捉到六十只神奇宝贝，然后找大木博士去升级图鉴。
2、此时你发现四天王暂时还无法进去挑战，因为四天王缺少了一位成员。
3、到枯叶市坐船，往1号岛的神奇宝贝中心跟右方机器的男士说话。
4、进入之前捕捉火焰鸟的山顶，然后在右方寻找之前两名火箭队成员的踪影，战斗完后进入洞穴寻找红宝石，里面会出现金银版的神奇宝贝喔，到深处会发现很多排点字的遗迹，然后再下楼梯，可拿走红宝石，完全达到以上条件之后，回去找上述所提到的男士说话，即可到1号岛的港口坐船，前往4、5、6、7号岛喔。
在群岛的4、5、6、7号岛中，玩家会多次遇上宿敌小茂，但都不用战斗。最令人兴奋的是这里有野生的金银版神奇宝贝出现喔，另外岛上的训练家大部分都是使用金银版神奇宝贝，而且等级都相当高，所以要特别注意。
玩家坐船到4号岛后，在右上方（渡湖过去）有个山洞，里面是冰洞里可找到秘传机07爬上瀑布，途中有采破冰以及滑冰方式前进喔，之后走到最深处看见四天王之一的科拿与火箭队组织战斗，和她联手把火箭队对战打跑，然后乘船到6号岛，到达6号岛后，到最南边的遗迹，在点字遗迹前使用01居合斩打开秘道，进入秘道之后往前方的洞跳下去，接着跳上方的洞、接着跳左边的洞、然后接着跳右边的洞、跳下面的洞就可以发现蓝宝石，但是却被一位奇怪科学家抢走了，然后到5号岛右下方的火箭队基地就能进入了。
在火箭队基地里经过一番战斗终于找到刚才偷走蓝宝石的博士，战胜他后可拿回蓝宝石，现在回去和1号岛的神奇宝贝中心，和在神奇宝贝中心机器前的男士说话，便可进行蓝宝石／红宝石的对战与传输了，接下来就能去华蓝市左方的洞窟去捕捉超梦喔，除了洞窟内的地形非常复杂，需要花点功夫熟习路线以外，超梦更是难收服，大家要有耐心喔。 回到5号岛，使用冲浪到东北方的不归洞穴，要在里面找到一位少女，这个洞穴非常神奇，如果玩家不依序特定的顺序走，永远都会回到原点，因此，用以下的方式走可得到四样道具及找回该名少女，以登山男子为该层为起点--
1、右→下，获得悠闲香水。
2、随便进入一个洞回到原点，右→上→下→上，获得海潮香水。
3、随便进入一个洞回到原点，右→上→下→下→右→右，获得元气块。
4、随便进入一个洞回到原点，右→上→下→下→右→左→下→左，获得升级糖果。
5、随便进入一个洞回到原点，右→上→下→下→右→左→下→右→上，就能找到少女了，和她战斗完后就顺便带她回家。
到达7号岛，北方有一个战斗塔，玩家不妨有兴趣进去挑战看看，往7号岛的南边走，经过木桥及一些草原，在中途分叉路往左走，草堆旁边发现有山洞，进去之后运用玩家的智慧将这七块石头推到七个坑洞上，就可以启动机关，离开那个洞继续往下走，发现海上各分布好几个遗迹呢，每只未知图腾出现点也不一样喔。
