通关以后回到自己的部屋，下楼见到妈妈，对话得知劲敌前来拜访，金岬市的港口已开，可以前往战斗区域、另外博士让主角去研究所一趟。
先去找博士，看到女主角在门口，对话得知冠凤镇老太太有请，飞到冠凤镇，在中上方的房间里跟老太太对话获得珍珠兽图鉴（珍珠版则获得钻石兽图鉴）。这样新奥图鉴基本就可以收集齐了——在这里补充一句，如果在通关前尽可能得与训练师对战，那么应该已经见过所有的怪兽，如果还有没见过的，那么请再去寻找吧（有的怪兽比如65号在游戏中只在鬼系道馆出现过，但此怪兽是珍珠版限定，那么玩钻石版的人只能请别人帮忙传一只过来了）。完成图鉴后回真砂镇找博士对话，这时大木老头赶到，升级图鉴为全国图鉴，同时221号道路的PALU公园可以开始使用（GBA联动），新的冒险正式开始！
飞往最上方的金岬市，与下方港口的船员对话后到达战斗区域，见到劲敌，接收红发女孩委托，接下来先去右边的建筑物里拿点数卡片，以后用来记录BP值的；向上走是战斗塔，在这里又遭遇第八道馆主和劲敌，不过不进行战斗。战斗塔里可进行对战挑战。
从战斗塔右下方进入230水路，向右路过229号水路到达名胜区，这里有一个建筑需要获得了选美大赛的缎带才能进入，暂时作用不明；从名胜区向上进入229道路，继续向上进入228道路，这里是风沙地带，注意这里是考验自行车快速转弯的地方，中间有个房间的老人教给三主角对应系别的最强技能。穿过228道路，从右下方向左进入226水路，左行来到遗迹区；继续右行进入225道路，一路下行经过城市玄关回到战斗区港口。整个地区的大回环完成。注意在最后的玄关出口处与旁边的钓鱼大叔对话可以获得高级钓鱼杆。
全特殊神兽捕获剧情
QUOTE:
1.第三只圣菇
已判明第三只红色圣菇将随机出现在全世界地图上，并且进入战斗就会逃跑，同梦兽一样无论是否遭遇过都不会显示在普通地图上，需要运用口袋手表的地图追踪功能进行追踪。超能系，等级50。
2.火钢兽
从226号道路右侧的玄关外向上进发（携带攀岩、碎石、怪力的怪兽），到达227号道路，这里是火山灰地带，看到水系馆主和劲敌，与此处小屋里的老人对话可休息回复体力；上山后会见到港口处的红发女孩；从左上侧进入洞穴，看到劲敌在此，他说只能帮女孩到这里了；继续进入洞穴与女孩组队，带她一起进入上方洞口，她将哈德山脉镇山石头拿走，发生震动后离开。
返回226水路左侧的遗迹区，在精灵中心左边的房间找到红发男，与其对话后离开，再次进入哈德山内洞穴深处，面参NO.485ヒードラン火钢兽，火+钢，等级70。
3.圣柱王
这个需要和GBA版进行通信。在第七道馆所在城市的中上方的房屋，当被人阻挡时道馆主会赶来承认主角的实力并允许进入，在最深处见到圣柱王，但并不会发生战斗，按照提示，把GBA版本的岩/钢/冰三圣柱传输到DS版中后（让其他人通过无线通信或WIFI传过来也可以，网上已经有人改出了三圣柱），携带这三只怪兽再来到这里就会进入战斗，捕获NO.486圣柱王レジギガス，普通系，等级70。
4.鬼龙
回到四天王前的洞穴，右侧原先堵路的胖子消失了，带上习得清雾的怪兽进入洞穴，看到在这里着急的女孩麻衣，与她结伴前行，到达右上方的洞口后她向主角道谢后离开，跟着她出洞，在最上方看到一个白色的空石板，不过暂时什么都没有……看起来像镜子一样？
把这个任务都完成后，214号道路右侧栅栏缺口处将开启新道路，带山回攀岩和碎石的怪兽进入后在湖泊上方的洞穴，进入后里面是巨大的岩石迷宫，用碎石可破坏岩石，但是这个迷宫真的很伤脑筋不知道该如何破解，石板上写着“……3本の柱を抜けて……に……を奉げる……が……30を越える前に……”暂时不知道什么意思，我承认我是瞎撞运气摸过过来的……谜题解开后见到No.487鬼龙ギラティナ，鬼+龙，等级5.梦兽
时间限定为夜及深夜，美央市（第六道馆城市）与左下方房屋内床上的小女孩对话后到旁边港口与船员对话到达满月岛まんげつじま，在深处见到NO.488梦兽クレセリア，超能系，等级50，它随后逃跑，拣起它留下的道具みかつきのはね（三日月的羽毛）后返回美央镇，交给小女孩后结束剧情。同第三只圣菇一样，梦兽将随机出现在地图的任何地方，运用口袋手表的地图追踪去追踪吧！
6.菲奥奈
玛娜菲的退化形态，只能通过让玛娜菲生蛋获得，但据说其并不能进化成玛娜菲，不仅如此，其能力比玛娜菲低一些，它的存在也是谜一样的存在，期待着从破裂的蛋壳中看到他的那个瞬间，NO.489フィオネ，水系。
7.玛娜菲
与DS前作《口袋RANGER》中完成的W任务进行通信互动后获得，被誉为海之王子的NO.490マナフイ，水系。
NO.491恶梦
得到会员卡,并解决船长女儿的梦魇事件后,进入口袋妖怪中心上方原来进不的房子,和眼镜男对话,然后上床睡觉,会梦到自己来到一个孤岛:新月岛,一直深入,在树林遇见40级的恶系神兽,恶梦.收服后醒来
NO.492草刺猬
得到大木博士的信,去冠军山洞内又侧的一个出口,需攀岩技能,传过山洞后来到224号道路,走到尽头后看到大木,对话之后,他会让玩家对着石头祈祷,之后前面会出现一条鲜花大道,走到尽头后见到,就见到30级的草刺猬
NO.493阿鲁萨乌斯
得到轮回之迪后,去殿元山,深入到捉迪亚路加的地方,会有迅问你要不要吹笛子,吹完之后,神兽祭坛前就会出现一条天梯,通天梯到达顶端,就会遇到传说中用1000只手创造宇宙的超神兽,在到达天梯顶端前应存档,否则一但看到超神兽它会自动扑上来…
其他分支剧情
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11.电鬼
时间限定为夜及深夜，从白岱市向左进入森林，发现第二道馆首领在此，对话后离开，使用秘籍01切断小树进入上方鬼屋，2F左侧第二个房间，调查电视后出现NO.479电鬼ロトム，电+鬼，等级15。携带的怪兽不要太厉害，人家只有15级……剧情里只出现一次的怪兽之一；
12.安农
在牛仔镇右侧有安农遗迹，在最底下的石板处写有暗比 可 胛粗 哟ナ保 觥 保 占 肴 ?6只字母安农后114号道路上方的洞穴出现新道路，左侧遗迹可捕获？和！形态，但不知道本作是否增添新形态安农。疑似本剧情与种族值720的超神兽有关。
13.3D龙
时间限定黄昏，在绿城下方的豪宅处与楼内主人对话会发生炫耀剧情，此后在黄昏时间可在屋后的草丛中可以捕获到3D龙原始形态。（开始疑似本剧情与草刺猬有关，现在看来不是……）
p.s.三只圣兽均要参加xxx活动才能得到关键道具，但有BUG可以抓到491和492（我用的烧录，决定可行，我试过），附上：
带会冲浪、飞天、瞬间移动/钻地的到第一个4大，手表记步器清0。穿过门第一格（冲浪消失处）右边200步，向下256步（累计456）左边63步（累计519）。此时已经到世界地图左上方，使用挖掘套装，然后返回地面，此时可能花屏，开物品栏回变好，向左边进入森林，就有40J的黑啸灵。捕获度同水菇一样
草刺猬：
来到刚才的第一格，右边200步，向下363步（合计563）再向右704（合计1267）下地再返回，这次花屏不要理会。一直往上走。路很长草刺猬在尽头的花海中！~ 30j,捕获度45？
p.s. 用此bug一旦失败，将造成永远困在bug中的情景，所以请烧录卡玩家备份存档，z版可以带一只中毒的pm，用毒死后回pm中心的方法逃出...
NO.493超圣兽嘛..用修改器改出轮回之笛吧~~
口袋妖怪钻石·珍珠全攻略：
首先在七釜户博士的一番介绍后，选完任务，就开始游戏啦！
刚开始是电视的介绍，不管他，先下楼，妈妈对你说黄头发男孩（下面文字中名为小纯）正在找你，于是你到双叶镇左上角房子门外，小纯出来了但有回去拿东西了，你便上楼找他，然后对话完到村口，你和他组队通行，走到神事湖，看见博士及助手，走后去草丛，然后LV2的胖胖翁出来对战，你选一只PM：嫩苗龟、小火猴和元企鹅，打完后回201道路，看见博士及助手，然后对话完回家。妈妈让你去真沙镇，到了后去研究所，然后领图鉴，在出门与助手走路走后，回家与妈妈对话，然后小纯妈来了，把地图交给主角（以下称为小辉），然后一路过五关斩六将，到达长寿市，去学校，把地图交给纯，于是他又给了你一张，然后留了，你可以在右边训练员出对战练级，打完获得技能训练集觉醒力量，然后出门碰到胡子大叔，让你寻找小丑，然后集齐3张兑换券，跟他换手表。还完往黑金市走，碰到纯，开打。打完后继续一路打，在大门里有人给你秘传技能碎岩。过了黑金山洞大门后，有人把你带到道馆前，但纯挡着，于是去黑金探矿最深处找平田，然后回道观，进去打，打完想索诺镇进发，途中会有银河团，长寿是顶端有两个，正和博士及助手大火拼，辉也参与进来，打完过山洞到索诺镇又打银河团，花海里打完后获得蜂蜜及钥匙，然后去发电厂，打好看门的混混后用钥匙开门，进去打完所有银河团成员后和三干事之一的玛姿打，打影后逃了，叔叔来了，小女孩来了，对话完然后可以出去了。接下来，往上走，一路打完训练员，进入森林，如果身上没药也不要紧，森林旁一个屋子里可以恢复，或者进去森林里，一个女孩跟你组队，是幸运蛋，每次打完怪兽都会帮你恢复。出去森林后到达白岱市，路过银河大楼有一个人出来，给你秘传技能1居合斩，然后可以去打GYM了，大好道馆后去银河大厦，树枝已经可以切断了，上楼在上上上！！！顶层看见一大叔和银河团三干事之一的朱庇特火拼，然后辉要打干事，打完叔叔叫你去1自行车店去，得到脚踏车后，开始向绿缘市进发。开过自行车道，向左转，这时，小光来了，给辉好东西，然后走了。继续走，穿过殿元山，路过果实名人家到达绿源市，馆主不在，可以参加华丽大赛，再向花蕊镇进发，途中有人会给你一个蛋，纯也会来跟你对战。209道路上有一个精灵塔，最高层有人给你秘传技能怪力。到达花蕊镇后，可以去遗迹，最深处有4个道具，可捡。然后向户长市进发，途中打败训练师后可得到许多道具，还有技能机可以捡。到达户长市后，去道馆，门前看见助手小光，他跟你说要去商店买东西，便走了，现在可以打道馆了。打完出来看见助手图鉴丢失了，便去银河团仓库前与银河团员开打，打完便可夺回图鉴。接著向野濑市进发，途中有酒店可休息、精灵对战。接著到了沙滩，左转，路过一户人家后可到野濑市，先去打道馆，打完在大湿园旁看见一银河团员在自言自语，然后跟著他走，一直到律师胡，然后对战，轻松虐杀。然后希罗那会给你秘传之药，到咖啡店旁的可达鸭用，用完道路变通了，根据道路走，深处有雾，只要用清雾就行，这个秘传技能在大湿园里有人给你。到达观风镇后，交还护符，去遗迹，看墙上的壁画老奶奶会给你秘传技能冲浪，不过要得到梅丽莎的徽章才可使用。於是，可以去绿源市，得知馆主回来了，便可去打。打完出道馆，冠军会叫你去美央市，长寿市左用冲浪到达。接著打道馆，途中桥上碰到纯，他要跟你对战，不过还是被我game over了。接著打完导管到团书馆顶层，发现博士及小光、小纯都在此，接著博士叫你去律师胡调查，突然爆炸了！博士叫你赶快去，事不宜迟，到达后去中央山洞中，与三干事的撒旦开打，打完撤退，去神事湖，博士被绑架了！小光被强奸了！小辉赶快英雄救美，与三干事的玛姿开打，打完撤退到英知湖，得知小纯没事，於是往右走到金押市，打完冰系道馆后再次去英知湖，得知三干事的朱庇特绑架了小纯，与奇凯达，打完回户长市，到银河团总部深处，看见赤木，与其开打，打完获得大师球，并通过传送器到秘密试验地，发现撒旦！再次开打，打完放掉三圣菇，去殿元山山顶，小纯和你来对战，打完三干事的两个后与赤木打，打完博士及小光来了，叫你去和神兽迪亚鲁卡打，你用个大师球或者超级球就捉住了。然后可去名目市，打完道馆到海滩上，馆主蜜柑给你秘传技能攀瀑，用它可登上瀑布到达冠军之路。通过冠军之路到达精灵联盟，打完所有天王级冠军，变通关了。
接著，欣赏一段动画，在重开，发现主角在家中，下楼妈给你传票，在金押市乘船，到达新奥岛，上面有遗迹区域、战斗区域和休闲区域。
还可以集齐图鉴去换全国图鉴。
还可以去捉电柜，森之洋馆里。
还能到密泉之道，有个洞窟，最深处有LV70的冥龙王，可捉下。
还可到坚硬火山深处捉LV70的炎刚巨兽。
现在还可到神殿里捉圣主王，但要与火红叶绿版本通信，获得三圣柱，才可与圣主王对战，或者捉服。
全攻略结束，祝楼主玩的愉快！！！
