《黑客帝国》中“母体”模拟了20世纪末地球通过电流刺激大脑，产生各种各样的生理感受，使人类在母体中处于“活”状态。少数幸存下来的人类躲在地下城市并试图侵入母体，寻找有潜力的人使其“醒来”加入对抗机器的行列，而且根据预言中有一位自称为“救世主”的人，具有打破母体规则的能力，当救世主出现时，人类才能战胜机械。由于“母体”的本质就是用机械的手段欺骗人类的假象，所以“探索真相”无疑成为了全片中最重要的话题，而《黑客帝国》则以它告诉了我们“真相”。
一般而言，所谓的真理是“一件事背后的缘由”，但在“一件事背后的缘由”背后隐藏着另一层原因吗？比方说，整部**都是围绕着救世主这个角色来寻找人类的救世主，就等于破译母体的真相，但由于每个人对于真相的需求各不相同，所以真相的定义也会随著不同的目的和期望而改变，而在挖掘真相的过程中，不仅能反映他们的个性。对发现的“真理”，他们也会有不同程度的执著，比如对于墨菲斯、崔妮蒂、和尼奥三个主角，表面上他们都执著寻找救世主这个真理，但对墨菲斯来说，他真正想要的答案是找到能结束战争的武器。
对于崔妮蒂来说，她真正想要的答案是‘找到她生命中的挚爱’，而尼奥真正想要的答案就是‘找出他到底是谁’，第三集的最后一幕则是再次挖掘真相。尼奥人和人类一直都认为“救世主”是终结机器的答案，但事实上的“救世主”只不过是机械师们用“希望”实现完全控制的另一种设计，“救世主”的概念在许多**或小说中都有过。和它们的设定大同小异那就是能够依靠一个人的力量去拯救这个濒临崩溃的世界，尽管《黑客帝国》也沿用了这一理念，但“母体”的设计却告诉了我们，其实每个人都可以成为自己的救世主。
有的，在**中，角色亲口表达了对于华纳兄弟希望重启《黑客帝国》系列决策的困惑与无奈。**末尾的彩蛋里，几名角色讨论该如何制作《黑客帝国4》时，干脆表示“现在宠物短视频这么火，还不如拍个《猫猫帝国》”。
《黑客帝国》该剧讲述了不久的将来，网络黑客尼奥（基奴李维斯 饰）对这个看似正常的现实世界产生了怀疑。他结识了黑客崔妮蒂（凯莉·安·摩丝 饰），并见到了黑客组织的首领墨菲斯（劳伦斯·菲什伯恩 饰）。墨菲斯告诉他，现实世界其实是由一个名叫“母体”的计算机人工智能系统控制，人们就像他们饲养的动物，没有自由和思想，而尼奥就是能够拯救人类的救世主。
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