如下：
1、产权关系不同。
加盟是独立主体之间的合同关系，各个特许加盟店的资本是相互独立的，与总部之间没有资产纽带；直营连锁属于同一资本所有，各个连锁店由总部所有并直接运营、集中管理。
2、法律关系不同。
加盟连锁（特许连锁）中特许人（总部）和被特许人（加盟店）之间的关系是合同关系，双方通过订立特许经营合同建立起关系，并通过合同明确各自的权利和义务。而直营连锁中总部与分店之间的关系则由内部管理制度进行调整。
介绍
加盟就是该企业组织，或者说加盟连锁总公司与加盟店二者之间的持续契约的关系。根据契约，必须提供一项独特的商业特权，并加上（人员培训、组织结构、经营管理、商品供销）的方面的无条件协助。而加盟店也需付出相对的报偿。
加盟特许经营的经营形式种类有很多，依出资比例与经营方式大概可以分为自愿加盟、委托加盟与特许加盟。
加盟店和直营店的主要区别在于经营范围和所有权。加盟店是属于加盟商的独立经营，他们可以以自己的方式运营店面，实现自身利润，只是有时需要向加盟商交纳一定比例的加盟费和年度分红。而直营店则是属于供应商，其经营步骤由总公司提供，只要按照总公司制定的营运模式和程序进行，就可以获得相应的利润。
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