主线：
1 云霄飞车杀人事件（Gin&Vodka初次登场，让新缩小变成了柯南）
2 董事长千金绑架事件（阿笠博士知道柯南身份，工藤新一化名江户川柯南，转入帝丹小学。）
4 大都会暗号地图事件(少年侦探团成立)
13 奇怪的寻亲杀人事件（宫野明美被警察逮捕）
43 江户川柯南诱拐事件(工藤夫妇得知柯南身份。)
48-49外交官杀人事件（服部平次登场,新一第一次回复）
52雾天狗传说杀人事件（柯南得知了琴酒和伏特加的代号） 54 电玩公司杀人事件（Tequila登场,被炸死）
57-58 福尔摩斯迷杀人事件(服部发现柯南身份）
128 黑衣组织十亿元抢劫事件（宫野明美被组织杀害）
129 来自黑衣组织的女子 大学教授杀人事件（灰原登场亮相。柯南第一次知道了药的名字是APTX4869）
170-171黑暗中的死角（新出智明的父亲被其继母杀害，在柯南的协助下破案。新出正式登场）
176-178与黑衣组织的再会（灰原解释了APTX4869原来是细胞程序性死亡。Vermouth在这里第一次露面。皮斯克与灰原的父母很熟悉，药的开发在灰原父亲的时代就开始了。GIN提到了“那位先生”，在以后会经常出现。灰原第一次恢复）
188-193 危命的复活（新一第二次恢复）
226-227格斗游戏的陷阱（茱蒂首次登场并与柯南相识，并看见他借助园子破案。）
230-231神秘的乘客（Vermouth再次露面，假扮新出与灰原同车。赤井秀一出场）
242 元太的灾难（灰原哀提到琴酒是左撇子。）
253-254 本厅刑事恋爱物语4（新出医生（贝尔摩得假扮）可能发现了柯南分析案情并利用变声器。）
258-259来自芝加哥的男子（詹姆斯·布莱克登场）
269-270犯罪的遗物（贝尔摩得偷走与毛利小五郎相关案卷，为了解新出的案子，并把FBI的注意力转向毛利，片尾赤井秀一监视侦探事务所，贝尔摩得计划得逞）
271-272 隐藏匆忙中的省略（茱蒂在谈话中暗示柯南其身份已经暴露，并且提到了FBI；在案件中兰回想起自己曾经见到过”带黑色针织帽的男子”（赤井秀一）；在故事结尾贝尔摩德发邮件给琴酒，提到了雪莉酒，并且向打了叉的宫野志保的照片发飞镖，旁边还有柯南和兰的照片）。
277-278 英语教师VS西部名侦探（柯南基本肯定了克里丝是组织的成员，并进一步怀疑茱蒂=克里丝，并与服部平次一起去茱蒂公寓试探，未果。在最后茱蒂的浴室的镜子后面出现的柯南和兰的照片，并且照片上的字迹和贝尔摩德的一模一样。柯南最后说的除茱蒂外的另两个可疑人物应该是赤井和新出。）
286-288 工藤新一NY事件（兰和新一救了Vermouth假扮的银发杀人魔。毛利兰初见赤井秀一）
289-290 光彦森林迷失记（灰原透露沼渊己一郎是组织成员）
307-308 遗留的无声证言(小五郎受托寻找失踪的电脑工程师板仓卓，从委托人的谈话中柯南了解到他就是当年在电玩公司杀人事件中被炸死的组织成员龙舌兰接触的对象。最后通过追查案件，柯南获得了组织的线索——板仓的日记)
309-311 与黑衣组织的接触（黑衣组织再度出场，柯南和GIN的第一次正面交手，柯南一度陷入危机，可最后不知是GIN放水还是疏忽，柯南侥幸逃过一劫。）
329-330金钱买不到的友情(阿笠博士提到哀的父亲宫野厚司是一个很有名的疯狂科学家，而母亲艾莲娜是一个英国留学生，并且黑衣组织可能正在从事让死人复活的计划。)
335-336 东都现象所的秘密(赤井秀一跟踪柯南和灰原，最后赤井对着哀的照片说了一句“真是太像了”暗示他和哀以前就曾相识)
338-339四台保时捷（博士借茱蒂的车将灰原送回了家，并找来新出医生给感冒发烧的灰原看病。Vermouth和茱蒂都发现灰原住处）
340-341 厕所里隐藏的秘密（灰原在父亲好友的设计所厕所里发现了姐姐留给自已的录音带。贝尔摩德在博士家安装窃听器，之后贝尔摩德打电话找组织成员“卡尔多瓦斯”来帮忙，正策划着某项行动。）
343-344便利商店的陷阱（茱蒂辞去了帝丹高中的老师的职务，不过在兰和园子到茱蒂家中开聚会时，兰意外发现了镜子背后的照片）
345 与黑衣组织的直面对决 满月之夜的二元推理（vermouth，茱蒂等人身份揭露，vermouth放弃追捕雪莉，并且向琴酒隐瞒了柯南和哀的事同时柯南听到了贝尔摩德给那位先生发邮件时的按键音。）
346-347寻找屁股上的印记（灰原哀拒绝了证人保护计划。）
361-362 帝丹高中校园灵异事件（真正的新出医生回归。）
374-375 星星和香烟的暗号（山村操给他奶奶发信息，开头按键音和Boss的邮件地址很像，是鸟取县）
385-387斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音（柯南知道boss的邮箱号，为七个孩子）
394-396奇异屋宇大冒险（柯南已经得知boss的手机号）
425 黑色冲击！黑衣组织的魔爪伸来的瞬间（Kir、Chianti、Korn登场。黑衣组织的杀人计划遭到FBI和柯南阻止，Kir受伤昏迷，被FBI捕获。）
429-430无法回头的二人（本堂瑛祐登场。）
462-465黑衣组织的影子（柯南注意到贝尔摩德去水无怜奈出事的目击者家询问，本堂瑛祐在到毛利侦探事务所做客时有意无意的把话题引向水无怜奈，并希望柯南等人前去调查）
484-485 黑色照片的去向（柯南和灰原哀进行调查，得到一张本堂瑛祐父亲的照片）
491-504 红与黑的碰撞（小兰的新同班同学本堂瑛佑总给柯南不好的感觉，他四处寻找自己的姐姐本堂瑛海，本堂瑛海与水无怜奈长相一摸一样，但是血型不对。黑衣组织四处寻找水无怜奈，得到FBI帮助的水无怜奈假装昏迷不醒，被本堂瑛佑袭击后不得不说出真实身份，原来水无怜奈就是本堂瑛海，代替被杀的父亲成为CIA的卧底，水无怜奈答应赤井秀一重新返回组织，但是接到的第一个任务就是杀死赤井秀一。赤井秀一疑似牺牲。）
507-508卡拉OK包房的死角（本堂瑛祐知道柯南身份，打算离开日本，柯南对赤井秀一已死的举动奇怪。）
509 红白**与侦探团 F/C（水无怜奈向茱蒂透漏情报，组织派出了一个厉害的侦探波本。冲矢昴登场，搬进工藤新一的房子。）
510 柯南VS双重暗号之谜
511 推理对决！新一VS冲矢昴（柯南发现冲矢昴的推理能力很强，而且是左撇子，爱喝波本酒。）
521 杀人犯 工藤新一
522 新一的真实身份与小兰的眼泪
523 真正想问的事 （新一第三次恢复）
542-543鱼儿消失的一角岩（灰原哀再次感到冲矢昴的压迫感。）
563-564侦探团VS劫匪团（脸上带着烧伤的伤疤、疑似赤井秀一的人出现，右眼有着明显的被火烧伤的伤疤。在最后此人捡起了抢劫犯的手枪，在柯南被抢劫犯劫持的紧张时刻，开枪救了柯南。）
578 召唤危机的红色前兆
579 黑色与13的暗示
580 逼近的黑之时限
581 摇曳的红色目标（疑似赤井秀一的人再度出现，同时，在商场的茱蒂老师收到了“这里很危险，快逃”的字条，此时冲矢昴也在商场，首次见到了伤疤男，说的话意味深长。伤疤男将在商场发生的案件的推理用别人的手机发给了毛利小五郎。琴酒以及基安蒂等人欲检验赤井秀一是否生还，并以此来证实基尔是否是卧底，却被柯南巧妙地引开。与此同时昴也在寻找伤疤男，而伤疤男却在被瞄准时对着瞄准镜露出诡异的笑容。）
616-621福尔摩斯的默示录（新一第四次恢复，并向兰告白。工藤夫妇知道灰原哀是APTX4869的研发者。）
622-623紧急事态252（阿笠博士被绑架，片尾灰原哀再次对冲矢昴表示强烈怀疑。）
646-647幽灵旅馆的推理对决（世良真纯登场）
651 柯南VS平次 东西侦探推理对决（茱蒂、卡迈尔在看到世良的照片后表示世良“很像某个人”，而詹姆斯则一眼看出世良是女孩子。）
656-657博士的视频网站（世良看到博士视频中印出来的灰原哀的影子，并向光彦、元太打听了“博士家的小女孩”（即灰原哀）、邻居（即冲矢昴）的情况。并对着冲矢昴的窗户说：“我还以为是谁随随便便地住进来了呢，不过现在看起来真是杞人忧天了啊……”最后世良将视频中意外拍到的灰原影像在电脑中删除。）
667-668婚礼前夜（安室透登场，成为小五郎弟子。）
671-674 侦探们的夜想曲（冲矢昴脱口而出的一句“不要露出那种表情”，似乎让灰原感到相当在意。Vermouth给波本打电话，安室透，冲矢昴，世良真纯同时接到电话）
675-676 一丁点都不原谅(灰原回想起冲矢的那句“不要露出那种表情”，和曾在组织卧底的诸星大（即赤井秀一）的用语十分相似。世良真纯对工藤新一似乎早有了解，对灰原哀表现出兴趣，并关注伤疤秀一)
681-683 以性命为赌注的恋爱转播（结尾处安室透为高木的指导警官伊达扫墓，暗示两人曾是朋友)
684-685 泡沫、蒸汽和香烟（灰原的举动和二人对话表示，冲矢的颈部隐藏着某个秘密）
690-691 工藤优作未解决的事件（冲矢昴举止可疑，世良在房间中发现了女性线索，最后世良含泪回望柯南和兰，说：“果然我是个坏孩子呢。”）
699-700 逼近灰原秘密的黑影（侦探团被困，灰原迫不得已服解药恢复身体，被光彦拍下视频，被世良、安室、冲矢看到。）
701-704 漆黑的特快列车（世良真纯，安室透身份揭晓。黑衣组织再次出场，目标雪莉。怪盗基德受柯南所托假扮宫野志保进入最后一节车厢，车厢脱落后，贝尔摩德引爆炸药，基德乘滑翔翼逃走。后贝尔摩德发现Sherry没死但未向组织报告。安室透对赤井之死产生怀疑，准备重新调查。冲矢昴露出与赤井秀一相同的眼神。）
705 密室中的柯南 （波本继续以安室透的身份出现）
706 在波本面前解谜（波本发现柯南使用手表型麻醉针，对其产生兴趣，并怀疑“沉睡的小五郎”与柯南之间的联系）
黑衣组织:
001 云霄飞车杀人事件
054 电玩公司杀人事件
118 浪花连续杀人事件
128 黑衣组织10亿元抢劫事件
129 来自黑衣组织的女子 大学教授杀人事件★
130 竞技场无差别胁迫事件(前篇）
131 竞技场无差别胁迫事件(后篇）
170 黑暗中的死角（前篇）
171 黑暗中的死角（后篇）
176 与黑衣组织的再会（灰原篇）
177 与黑衣组织的再会（柯南篇）
178 与黑衣组织的再会（解决篇）
222 人鱼失踪记（事件篇）
223 人鱼失踪记（推理篇）
224 人鱼失踪记（解决篇）
226 格斗游戏的陷阱（前篇）
227 格斗游戏的陷阱（后篇）
230 谜一样的乘客（前篇）
231 谜一样的乘客（后篇）
242 元太的灾难
253 本厅的刑警恋爱物语4（前篇）
254 本厅的刑警恋爱物语4（后篇）
258 来自芝加哥的男人（前篇）
259 来自芝加哥的男人（后篇）
269 犯罪的纪念品（前篇）
270 犯罪的纪念品（后篇）
271 急忙掩饰的忽略（前篇）
272 急忙掩饰的忽略（后篇）
274 幽灵屋的真相（前篇）
275 幽灵屋的真相（后篇）
277 英语教师vs西部名侦探(前篇)
278 英语教师vs西部名侦探(后篇)
279 迷宫的阴暗（前篇）
280 迷宫的阴暗（后篇）
284 中华街 雨中的似曾相识(前篇）
285 中华街 雨中的似曾相识(后篇）
286 工藤新一NY事件（事件篇）
287 工藤新一NY事件（推理篇）
288 工藤新一NY事件（解决篇）
289 迷茫森林中的光彦（前篇）
290 迷途森林中的光彦（后篇）
305 看不见的嫌疑犯（前篇）
306 看不见的嫌疑犯（后篇）
307 无声的证词（前篇）
308 无声的证词（后篇）
309 与黑衣组织的接触（交涉篇）
310 与黑衣组织的接触（追踪篇）
311 与黑衣组织的接触（决死篇）
312 夕阳染红的女儿节人偶（前篇）
313 夕阳染红的女儿节人偶（后篇）
329 金钱买不到的友情（前篇）
330 金钱买不到的友情（后篇）
333 相似的公主（前篇）
334 相似的公主（后篇）
335 东都冲印所的秘密（前篇）
336 东都冲印所的秘密（后篇）
338 4辆保时捷（前篇）
339 4辆保时捷（后篇）
340 洗手间里隐藏的秘密（前篇）
341 洗手间里隐藏的秘密（后篇）
343 便利店的陷阱（前篇）
344 便利店的陷阱（后篇）
345 与黑衣组织正面对决 满月之夜的二元推理★
346 寻找屁股上的印记！（前篇）
347 寻找屁股上的印记！（后篇）
350 被遗忘的手机（前篇）
351 被遗忘的手机（后篇）
361 帝丹高中学校怪谈(前篇)
362 帝丹高中学校怪谈(后篇)
371 沉默的航线（前编）
372 沉默的航线（后编）
374 星星与香烟的暗号（前篇）
375 星星与香烟的暗号（后篇）
385 斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音(上)
386 斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音(中)
387 斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音(下)
394 奇异屋宇的大冒险（封印篇）
395 奇异屋宇的大冒险（机关篇）
396 奇异屋宇的大冒险（解决篇）
425 黑暗冲击！ 被组织的魔爪触碰的瞬间★
427 超秘密的上学路（前篇）
428 超秘密的上学路（后篇）
429 无法回到从前的两个人(前篇）
430 无法回到从前的两个人(后篇）
446 被封印的欧式窗（前篇）
447 被封印的欧式窗（后篇）
462 黑衣组织的影子 年幼的目击者
463 黑衣组织的影子 奇妙的照明
464 黑衣组织的影子 谜样的高额报酬
465 黑衣组织的影子 珍珠的流星
466 坚不可摧的雪人（前篇）
467 坚不可摧的雪人（后篇）
479 和服部平次在一起的3天★
484 黑色照片的行踪（前篇）
485 黑色照片的行踪（后篇）
491 红与黑的碰撞 开端
492 红与黑的碰撞 血缘
493 红与黑的碰撞 疾呼
494 红与黑的碰撞 冥土
495 红与黑的碰撞 昏睡
496 红与黑的碰撞 侵入
497 红与黑的碰撞 觉醒
498 红与黑的碰撞 扰乱
499 红与黑的碰撞 伪装
500 红与黑的碰撞 遗言
501 红与黑的碰撞 嫌疑
502 红与黑的碰撞 洁白
503 红与黑的碰撞 决死
504 红与黑的碰撞 殉职
接下来只有冲失昂出场跟主线有关 他是黑衣组织新出动的成员波本
也有人说他就是赤井秀一的
509 红黄白色与侦探团
510 柯南vs双重暗号之谜
511 推理对决！新一VS冲矢昴
525 令人憎恨的蓝色火花（后篇）
这是他出场的集数
漫画里演的更多一些
名侦探柯南第640话 营救
名侦探柯南第639话 讯息
名侦探柯南第638话 纸飞机
名侦探柯南第664话 一角岩
名侦探柯南第665话 鱼
名侦探柯南第666话 杀气
名侦探柯南第691话 柯南vs侦探团
而且漫画里赤井秀一已经登场了 而且还和朱蒂谈过恋爱呢
新一:
TV版：
001 云霄飞车杀人事件（初登场）
002 董事长千金绑架事件 （兰的回忆&.远影）
007 每月一件礼物威胁事件 （远影）
010 足球选手恐吓事件 （照片、想像&.投影）
018 六月新娘杀人事件 （回忆）
026 爱犬约翰杀人事件 （回忆）
032 咖啡店杀人事件 （回忆）
042 卡拉OK厅杀人事件 （远影）
048 外交官杀人事件(前篇) （回忆）
049 外交官杀人事件(后篇) （喝白干变大）
057 福尔摩斯迷杀人事件(前编) （回忆）
076 柯南对怪盗基德 (远影)
084 滑雪别墅杀人事件(前篇) （回忆）
096 走投无路的名侦探 连续两大杀人事件 （照片＆.想像）
100 初恋情人回忆事件(前篇) （回忆）
101 初恋情人回忆事件(后篇) （回忆）
118 浪花连续杀人事件 （平次的梦－－工藤被袭击）
129 来自黑暗组织的女子 大学教授杀人事件 （远影）
162 飞天密室！工藤新一最初事件（兰睡梦中回忆的）
190 危命的复活～第三种选择（平次扮的）
191 危命的复活～黑衣骑士 （变回来的）
192 危命的复活～新一回来了（药效没过）
193 危命的复活～约定的场所（药效没过，但结尾就过了）
196 看不见的凶器 小兰的初次推理 （兰的想象）
219 名侦探大集合 工藤新一vs怪盗基德 （回忆）
228-暗藏杀机的陶艺教室 (前篇)（兰的想象）
239 大阪的3个K事件(后篇) （远影）
250 偶像们的秘密(后篇) （星野辉美手中的剪报）
255 松江玉造连句十四次胜负(前编) （出现原因不明新一看见小狗走神）
271急忙掩饰的忽略 (前篇)（小兰上课走神，想起了赤井秀一和新一）
278 英语教师VS西部名侦探(后编) （照片）
280 迷宫的阴暗（后篇）（柯南回忆足球明星比护来学校找他加入球队）
285 中华街雨中的似曾相识(后篇) （兰的错觉)
286 工藤新一NY事件(事件篇) （回忆）
287 工藤新一NY事件(推理篇) （回忆）
288 工藤新一NY事件(解决篇) （回忆）
300 友情与杀意的关门海峡(后篇) （回忆）
304 震动的警视厅 1200万人质 （兰的错觉＆.远影）
312 染上夕阳的布偶(前篇)（回忆）
330 被挑拨的友情(后篇)（回忆）
331 疑惑的咖喱饭(上篇)（想像）
343 便利店中的阴谋(前篇)（回忆&.远影）
344 便利店中的阴谋(后篇) （错觉、照片&.远影）
345 直面黑色组织的对决！满月之夜的二元神秘事件（假扮&.回忆）
383 来自甲子园的恶魔的挑战（兰的回忆）
387 斯特拉蒂瓦里的不谐和音（尾曲）（柯南回忆自己唱歌）
398 奇妙一家的委托(前篇) （想象）
400 心存疑惑的兰(回忆&.远影）
410 同时进行的舞台剧和绑架案(后篇)（回忆）
411 神社鸟居之惊悚暗号
412 神社鸟居之惊悚暗号（远影）
422 银杏色的初恋(后篇)（回忆）
413 完全一半犯罪之谜 （柯南的回忆）
437上户彩和新一 四年前的约定（回忆）
456 我喜爱的推理 （回忆看齐川的小说）
457 园子的红手帕(前篇)（园子给兰打比方……）
472 少年工藤新一的冒险(前篇)
473 少年工藤新一的冒险 (后篇)
490 工藤新一vs服部平次 滑雪场的推理对决（中学时候，推理部分最好看）
508卡拉OK厅的死角(后篇)（回答瑛佑的问题：想要和兰表白……的时候远影）
511 推理对决！新一vs冲矢昂（最后和兰打电话时的远影）
521 杀人犯、工藤新一（以其身份登场的是个整容的犯人，真人开始是柯南，之后化妆成死罗神）
522 新一的真实身份和兰的眼泪
523 真正想问的事
524 憎恶的蓝色火花(前篇)（开头一些提到了）
特别企划：
鲁邦三世VS名侦探柯南（兰的幻想）
剧场版：
1997 引爆摩天楼 （远影）
1998 第十四个目标 （远影&.回忆）
1999 世纪末的魔术师 （错觉&.假扮）
2000 瞳孔中的暗杀者 （照片、远影&.回忆）
2001 通往天国的倒数计时 （远影）
2002 贝克街的亡灵 （兰的回忆）
2003 迷宫的十字路 （回忆&.变回来的&.远影）
2004 银翼的魔术师 （假扮&.远影）
2005 水平线上的阴谋 （回忆&.远影）
2006 侦探们的镇魂歌 （回忆&.远影）
2007 绀碧之棺 （兰的回忆）
2008 战栗的乐谱 （兰的回忆）
2009 漆黑的追迹者
剧场特典：
剧场版12特典：工藤新一 迷之墙和黑色拉布犬事件
剧场版13特典：新兰·麻将牌与七夕的回忆
OVA：
OVA1－柯南vs基德vs铁剑
OVA2—十六个嫌疑犯（兰的回忆、平次的错觉）
OVA8—女子高中生侦探 铃木园子的事件簿（兰的想象）
特辑：
飞上天空的十颗行星
真人版电视剧:
第一集（2006）致工藤新一的挑战状~消失前的序曲
第二集（2007）工藤新一的复活~与黑暗组织的对决
怪盗基德:
在《魔术快斗》中的登场：
Ⅰ卷
⒈《复活的怪盗》
⒉《警官的云集》
⒊《时钟装置的心》
⒋《怪盗基德忙碌的假日》
⒌《海盗船浮不起来》
⒍《绯红的诱惑》
Ⅱ卷
⒈《跟他绝交》
⒉《日本最不负责的总理》
⒊《我是首领》
⒋《不理解我是大人》
⒌《赌球少年》
⒍《扮鬼游戏》
⒎《桌球高手VS魔术师》
Ⅲ卷
⒈《星战》
⒉《名侦探登场》
⒊《眼皮底下的怪盗》
⒋《红子送上门的信》
⒌《铁剑VS快斗》
⒍《蓝色生日》
⒎《绿之梦》
Ⅳ卷
⒈《基德与水晶之母》
⒉《红色之泪》
⒊《江古田钟楼（前篇）》
⒋《江古田钟楼（后篇）》
⒌《黄金之眼（前篇）》
⒍《黄金之眼（后篇）》
⒎《黑暗之卷（前篇）》
⒏《黑暗之卷（后篇）》
在《名侦探柯南》动画中的登场：
TV：
076 柯南vs怪盗基德
132 魔术爱好者杀人事件(事件篇）
133 魔术爱好者杀人事件(疑惑篇）
134 魔术爱好者杀人事件(解决篇）
219 被召集的名侦探!工藤新一vs怪盗基德
356 怪盗基德的惊异空中步行
394 奇异屋宇的大冒险（封印篇）
395 奇异屋宇的大冒险（机关篇）
396 奇异屋宇的大冒险（解决篇）
469 怪盗基德与四幅名画（前篇）
470 怪盗基德与四幅名画（后篇）
472 工藤新一少年时的冒险（前篇）
473 工藤新一少年时的冒险（后篇）
剧场版：
M3 世纪末的魔术师
M8 银翼的魔术师
M10 侦探们的安魂曲
OVA：
OVA1 柯南vs基德vs阿剑 宝刀争夺大决战!!
OVA4 柯南与基德与水晶之母
OVA6 追踪消失的钻石!柯南·平次VS基德!
剧场特典：
M8特典：银翼的时间之旅
M10特典：感恩10周年！！柯南奖颁奖典礼
真人版：
SP1 给工藤新一的挑战书 再见前的序章
3D特别篇：
柯南VS基德！漆黑的狙击手
柯南VS基德！鲨鱼和珠宝
在《名侦探柯南》尚未动画化的漫画中的登场：
631话《紫红之爪》
632话《瞬间移动》
633话《三个戒条》
634话《Zero》
《名侦探柯南》中出场：
076 柯南对怪盗基德 1小时特别篇(コナンVS怪盗キッド) 《柯南VS怪盗基德》1997/09/22
目标：漆黑之星（黑暗星辰）Black Star
预告函：愚人节，当月亮将两人分开时，在漆黑之星的名下，受邀到波涛上，我必驾到…
——怪盗基德
解读：“月亮分开之时”指月亮介入人造卫星与太阳之间的那一刻，他应该以BS电台为基点，时间是深夜十二点到四点之间。“受邀到波涛之上”的“波”表示 “电波”，他应该是会从BS电台的发射电波的方向前来。BS电台的电波是由南向西四十五度，仰角四十二点三度的方向发射讯号，从米花博物馆看，地点是—— 杯户大饭店的屋顶！
易容人物：小兰
逃跑方式：游泳潜逃
在本集中，KID推测出铃木朋子身上戴的是真正的黑暗星辰，于是让假珍珠爆炸从而引起混乱，趁朋子跌倒将其扶起时，拿到珍珠。
经典语句：如果说怪盗是个技艺精湛、**财宝、富有创造性的艺术家，侦探就是一个只会跟在拐到后面吹毛求疵，充其量不过是个评论家的人物罢了。
132 魔术爱好者杀人事件(事件编) (奇术爱好家杀人事件（事件编）) 1999/01/25
133 魔术爱好者杀人事件(疑惑编) (奇术爱好家杀人事件（疑惑编）) 1999/02/01
134 魔术爱好者杀人事件(解决编) (奇术爱好家杀人事件（解决编）) 1999/02/08
易容人物：突金塔克树
逃跑方式：用滑翔翼逃走
在本集中，KID易容成突金塔克树,网名红色贝鱼，参加了“魔术爱好者联盟”的一个聚会，实质想调查一下已死的欺骗童子（魔术师春井风传出道前用的名字，其孙女用此网名继续通信）为什么能继续通信。其间发生命案，在剧末基德大人才现出原形。
经典语句：（对柯南）再见，小弟弟。当世纪末的钟声敲响时，我们定会再见面
356 怪盗基德之奇异的空中步行 1小时特别篇(怪盗キッドの惊异空中歩行) 2004/04/12
目标：大海的奇迹Blue Wonder（其实是铃木家的财团顾问铃木次郎吉向KID发出的挑战信，KID对这个没兴趣，但还是接受了挑战，并说徒步来取）
易容人物：铃木次郎吉（逃跑时）
在本集中，KID让其手下（我认为应该是他的管家）驾驶7号机混入警方的直升机中，从机上掉两根钢丝线，让KID看似悬浮在空中，然后又报告说KID头上没有钢丝线，柯南等人在两旁也均未发现，“先入为主”的思想使柯南陷入困惑：人的血肉之躯怎么能抵抗重力！
易容人物：铃木次郎吉（逃跑时）
KID，柯南经典对话：
K：这也可以称Blue Wonder，天空中奇迹逃离
柯：天空？Blue Wonder的Blue是大海的颜色哦
K：不是一样吗？海和天都是蓝色的。侦探和怪盗也是一样，虽然看上去有天壤之别，但是追根溯源，都是因为好奇心，而去探索发觉别人隐藏的某些东西的无礼之徒。
柯：笨蛋。天空和海洋的蓝色是因为光的散射和反射，性质完全不同，不要混为一谈。作为证据，水塘可不是蓝色的哦
K：你这家伙还真是缺乏梦想
柯：光是梦想就无法看穿真相了
219 名侦探大集合 工藤新一vs.怪盗基德 2小时特别篇(集められた名探侦！工藤 新一VS怪盗キッド) 《名侦探的聚会！工藤新一VS怪盗基德》2001/01/08
目标：钟上的秒针（其实是为了保住和青子初次见面的地方，在钟面上刻下暗号，意为“这钟台的钟声不会交给你”，后来钟台交警方处理，发现宝石已被调换，将原本想改建成广告版的钟台保留下来），黄金之馆的宝藏
预告函：满月的周六夜晚，随着零时的钟响，我将前来拜领大钟——怪盗基德；
邀请函：上帝遗弃之仔的幻影
解读：（邀请函）幻影就是“phantom” ，也就是神出鬼没，不具有实体；“仔”指幼犬，上帝遗弃之犬在新约圣经里的意思是不受上帝所祝福的“山羊”，“仔山羊”就是“小山羊”的意思。在英文里的山羊念goat,不过小山羊念“kid”，也就是“Kid the phantom thief”
易容人物：泉水阳一（一名普通巡警），毛利小五郎
在本集中，KID在放出烟雾的同时切断钟面广源，放下屏幕，将指针消失的影像通过投影仪放出。后在新一的步步胁迫下随着屏幕一起落入人群中，勉强逃走，并变回快斗重演与青子在钟塔下相识的一幕。这是前半部分，即KID偷Black Star之前的回忆，后有人冒用KID的名字邀请六名侦探到“黄昏之馆”寻宝（白马探，茂木遥史，苍田郁美，毛利小五朗，大上祝善，千间降代），署名“上帝遗弃之仔的幻影”．
剧场版
M3 世纪末的魔术师 (世纪末の魔术师) the last wizard of century 1999/04/14
目标：罗曼诺夫王室密宝——皇帝复活节之蛋
预告函：由黄昏的狮子到拂晓的少女，当没有秒针的时钟走到第十二个字的时候，我将从发光的天空楼阁降临，收下回忆之蛋
——世纪末的魔术师
解读：“由黄昏的狮子到拂晓的少女”意味着狮子座的最后一天——8月22日黄昏，一直到处女座第一天的黎明，这代表犯案的日子，在这句话中，从头数起的第十二个字是へ（日文中有前往、直到的意思），预示着犯案时间是7点20分，“发光的楼阁”指用来预报气象的通天阁．
易容人物：白鸟任三郎
在本集中，KID得知警方已将蛋移至别处，于是让全城停电，找出除了饭店、医院以外还有灯亮的地方，成功拿到回忆之蛋。不料却被神秘狙击手“史考兵”所伤，蛋完璧归赵，鸽子为保护主人收了重伤，被柯南救回。因此在柯南差点被小兰识破身份之际，KID易容成新一（其实只不过是变换发型而已~）使柯南再次摆脱危机。
经典语句：Ladies and gentlemen.It’s a show time!．
(对柯南）给你一句忠告，世上有些事最好让它永远成为谜。还有一个谜题你解得开吗，名侦探。我为什么要以工藤新一的样子出现，去解救一个棘手的敌人
M8 银翼的魔术师 (银翼の奇术师) 2004/04/17
目标：命运的宝石（星蓝宝石，如此命名是因为它上面浮现出来的3条线分别象征信赖 希望 命运）
预告函：罗密欧、朱丽叶、征服者、喝彩。在26个字母中飞舞交错中，我将前来取走‘命运的宝石’
——怪盗基德
解读：26个字母是指无线电通讯中的所有通话编码，暗示罗密欧、茱丽叶、征服者、喝彩分别是语音码（这是在无线通讯中为了防止听错的通话编码，R代表 Romeo(罗密欧) 、J代表Juliet（茱丽叶）、V代表Victor(征服者) 、B代表Brave(喝彩)，这些也用于飞机的无线电通讯中），而飞舞交错是指飞机在飞行时拿这些开头字母用于通讯，即将在飞机上作案。
逃脱方式：用滑翔翼逃走，从飞机上跳下后借助滑翔翼逃走（同时引来一排警车给准备降落的飞机提供亮光，使其能安全降落）
基德的一封通告信与一束玫瑰掀开了故事的序幕。“宝石”的主人树里因对基德的惧怕找到了我们的“名侦探”毛利小五郎，期望以此能化解这突如其来的不幸。
接受委托的毛利、柯南一行应邀来到宇宙剧场观看舞台剧《约瑟芬》，希望从中找到有关线索，粉碎基德的阴谋。在树里的化妆室，片中的主要人物纷纷赶来。正在观察周身人群是否有基德的柯南却意外的遭遇了“工藤新一”的登场。指证此人是基德的柯南却因种种原因暂时罢休。舞台剧中，柯南一边观察舞台上的动静，一边监视着“新一”，当基德动身的一刻，柯南也展开了行动。在一番激烈的角逐后，基德还是顺利逃脱了。
为了庆祝舞台剧的成功结束，树里等人执意邀请毛利一行到树里别墅参加庆功会。柯南等人便登上了飞往函馆的班机。一心只想着追捕基德的柯南意外的碰上了树里被杀害的案件（有柯南在的话，不知说“意外”是否恰当？）在种种的证据下，树里的化妆师酒井夏树承认了罪行。原因是被害人生前百般阻挠夏树到好莱坞工作，破灭了酒井的人生理想～因为被毒害的树里与机长有过一阵寒暄，所以机长等驾驶人员身体也受到毒药的影响，无法驾驶飞机。假扮新庄功的基德同柯南又连手驾驶飞机，演出了一场惊心动魄的灾难**，并最终取得了胜利。其中最令柯南满足的是小兰的一句“我喜欢你！”，而最后小兰却认为通电话特意给她鼓励的是基德假扮的新一（因为他们通电话时，飞机突然振动，柯南用变小后的声音不小心叫了一声，且她觉得新一太了解她发生的事－就像在她身边一样〔本来就在她身边〕）。
易容人物：新庄功
经典语句：这位**，后会有期，希望下次能在美丽月光下重逢
M10 侦探们的镇魂歌 （探侦たちの镇魂歌） 2006/04/15
KID在4月4日偷走了深山美术馆一颗大宝石，逃走时与抢劫运钞车的歹徒相遇并看到了歹徒的真面目，虽已还回宝石（这是KID的一贯作风）但从此遭到了拥有深山美术馆的深山社长的追杀．正巧，其中一位歹徒召集小五郎、服部等名侦探调查与抢劫案相关的三个案件，KID便易容成白马探与柯南、服部一同调查案件想找出被追杀的真正原因．原来深山社长是歹徒的学长，事后歹徒们曾向他寻求对策，他便找来杀手想杀人灭口．最后KID单刀赴会，开枪引来警察，留下深山社长及他全是赃物的美术馆，还有能招出不少口供的两名杀手．
易容人物：白马探
经典语句：你以为我会毫无准备的单刀赴会吗
OVA
OVA1柯南 vs. Kid vs. Yaiba 宝刀争夺大作战
目标：宝刀
逃脱方式：利用其帅气的外表和亲吻对女性加以引诱，而使他们陷入幻想，（这招用于上至老太婆下至中学生，且百发百中）不过最后被炸飞咯．
看这集的时候总觉得怪怪的，最后才发现其实这只是柯南做的梦，且搞笑的是柯南居然运用推理发现一切从早上开始很不寻常：步美的发型，元太的斑秃，光彦的雀斑也不见了，小五郎的刘海从两撮变成了三撮，小兰刘海的方向也与原来不同，正当他迷惑时传来了小兰叫柯南起床的声音．（其中他在梦中喝了Yaiba的奶奶所说治百病的药，一会儿变成毛利，一会儿变成服部，结果被误认为是基德遭到追杀，最后好不容易才变成工藤）其实这集原是《Magic快斗》里的一部分，居然变成了柯南的梦，呵呵……
OVA4基德与水晶之母
目标：英格兰姆帝国的国宝，号称欧洲最大的宝石——水晶之母
潜逃方式：用飞走的假人使警察认为他已逃脱而又恢复自己的身份．
本集中，快斗和青子因为中森警官的关系得以搭上东京开往大阪的列车，并且可以到女王所在的沙龙里。与此同时，小兰和柯南应服部之邀去大阪，恰好也在此。柯南得知KID发出预告函，并告示女王的儿子KID偷到宝石后会到列车顶上，不料却被正在通缉的宝石大盗杰卡尔听到。快斗已确定女王身上所带是假的，在女王和中森警官喝酒时，发现酒中的冰块没有化，终于找到藏宝地。随后在列车顶上与杰卡尔对峙，最后成功脱险。这集也曾是《Magic快斗》里的一部分．
经典语句：（对女王）您别忘了您是皇后的同时也是拥有红心的母亲
怪盗基德是神出鬼没的！
OVA6追踪消失的宝石! 柯南&平次VS基德
其实基德早已盯上了这颗市值一亿却被盗的宝石，所以在发预告函之前就一直跟着柯南与平次，待他们破案后，正与盗贼打斗时夺走宝石
服部:
TV:
048 外交官杀人事件（前篇）
049 外交官杀人事件（后篇）
057 福尔摩斯迷杀人事件（前篇）
058 福尔摩斯迷杀人事件（后篇）
077 名门连续惨死事件（前篇）
078 名门连续惨死事件（后篇）
117 推理小说家失踪事件（后篇）
118 浪花连续杀人事件
141 结婚前夜的密室事件（前篇）
142 结婚前夜的密室事件（后篇）
166 鸟取蜘蛛屋的怪物（事件篇）
167 鸟取蜘蛛屋的怪物（疑惑篇）
168 鸟取蜘蛛屋的怪物（解决篇）
174 20年的杀意 新佛尼号连续杀人事件
188 危命的复活 洞窟中的侦探团
189 危命的复活 负伤的名侦探
190 危命的复活 第三个选择
191 危命的复活 黑衣骑士
192 危命的复活 新一回来了…
193 危命的复活 约定的场所
220 满口谎言的委托人（前篇）
221 满口谎言的委托人（后篇）
222 人鱼失踪记（事件篇）
223 人鱼失踪记（推理篇）
224 人鱼失踪记（解决篇）
238 大阪的3个K事件（前篇）
239 大阪的3个K事件（后篇）
240 新干线护送事件（上集）
263 大阪双重迷案 浪花剣士与太阁之城
277 英语教师VS西部名侦探（上）
278 英语教师VS西部名侦探（下）
291 孤岛的公主与龙宫城（事件篇）
292 孤岛的公主与龙宫城（追求篇）
293 孤岛的公主与龙宫城（解决篇）
323 服部平次一筹莫展（前篇）
324 服部平次一筹莫展（后篇）
325 火焰中的红马（事件篇）
326 火焰中的红马（搜查篇）
327 火焰中的红马（解决篇）
345 与黑衣组织直面对决 满月之夜的双重迷案
381 谁的推理秀（前篇）
382 谁的推理秀（后篇）
383 甲子园的奇迹 绝不能输给看不见的恶魔
406 柯南和平次的推理魔术（操纵篇）
407 柯南和平次的推理魔术（公馆篇）
408 柯南和平次的推理魔术（解决篇）
479 和服部平次一起的3天
490 服部平次vs工藤新一 滑雪场的推理对决
491 红与黑的碰撞 开端
剧场版:
M3：世纪末的魔术师
M7：迷宫的十字路
M10：侦探们的安魂曲
OVA:
2：16个嫌疑犯！？
3：柯南与平次与消失的少年
6：追踪消失的钻石！ 柯南·平次VS基德！
