车管所办理。
机动车发动机缸体更换需要随车辆持该车辆所有人身份证明原件、行驶证、机动车登记证书、新发动机缸体发票、三级资质以上修理厂证明、填写《机动车变更登记申请表》（单位车辆还须加盖公章）并在新发动机缸体上按原钢印号码打印，到车管所检验窗口核办就可以了。
要知道更换发动机和改变车身颜色、更换车身或者车架、因质量问题更换整车、营运机动车改为非营运机动车或者非营运机动车改为营运机动车使用性质改变这几种是一样的需要办理变更申请。
扩展资料：
要注意的是机动车更换发动机缸体的无号码时在未装车前，可带新发动机缸体持车辆所有人身份证明、行驶证、登记证书、缸体合格证到车管所，核对后开具委托书打刻原发动机号，装车后无需上线检测，持上述手续到车管所办理变更登记。
如更换的缸体上带有出厂时打刻的编号，应自行核对或到车管所核对发动机型号相符后，到安验机构上线检验，取得检测报告单后持车辆所有人身份证明、行驶证、登记证书、发动机合格证到车管所办理变更登记。
浙江政务服务网——机动车变更登记（备案）
改发动机号是可以看出来的：1、发动机号码在行驶证上和绿色的机动车登记证上都有的另外发动机的编号一般都印在发动机缸体上打开引擎盖在发动机上的标号就是了；2、具体的位置各厂家有所不同还需查阅车辆说明书；3、汽油发动机通常是两大机构五大系统组成：曲柄连杆机构——实现热能转换的核心也是发动机的装配基础。配气机构——保证气缸适时换气。燃料系——控制每循环投入气缸燃油的数量以调节发动机的输出功率和转速。冷却系——控制发动机的正常工作温度。润滑系——减少摩擦力延长发动机的使用寿命。点火系——适时地向汽油发动机提供电火花（柴油发动机无点火系）。起动系——使曲轴旋转完成发动机起动过程。
