双母线母差保护选用大差作为区内故障的判断依据。
大差：将双母线作为一个整体，差流值超过整定值判为区内故障，母差保护启动，但无法确定故障点。
小差：将两段母线看作两个元件，母差保护启动后，进行故障母线选线，即判断出是哪一段母线故障。
母差保护动作流程是：大差启动保护后，小差选线。确定故障段后，跳本段所有元件和母联断路器。
如果故障发生在元件内部，那么对于这个元件来说就会有流向元件的电流。但是在元件正常工作而故障发生在原件外部时，那么对于这个元件来说，流入元件的电流和流出的电流相等。因此通过比较电流的方向就能够判定故障是发生在元件的内部，还是发生在外部。
